235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0248 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0248  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  390  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02100  hypothetical protein  91.33 
 
 
196 aa  359  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  64.25 
 
 
193 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  60.32 
 
 
197 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0638  hypothetical protein  60.85 
 
 
194 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4570  hypothetical protein  60.85 
 
 
194 aa  227  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000582787  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0674  hypothetical protein  60.32 
 
 
197 aa  226  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0593  hypothetical protein  61.38 
 
 
194 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195431  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0633  hypothetical protein  61.38 
 
 
194 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000102941  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3700  hypothetical protein  60.94 
 
 
194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0091  hypothetical protein  57.84 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3312  hypothetical protein  52.94 
 
 
209 aa  190  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  53.4 
 
 
206 aa  190  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0874  hypothetical protein  51.87 
 
 
229 aa  181  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0820  hypothetical protein  51.87 
 
 
229 aa  181  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  50.26 
 
 
198 aa  174  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  51.37 
 
 
201 aa  164  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4327  hypothetical protein  47.34 
 
 
199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  44.79 
 
 
195 aa  155  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  42.86 
 
 
212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  44.15 
 
 
204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  42.78 
 
 
200 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  41.45 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  41.94 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  40.31 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  42.39 
 
 
203 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  40.84 
 
 
194 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  37.56 
 
 
203 aa  124  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  37.56 
 
 
203 aa  124  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  37.56 
 
 
203 aa  124  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  41.81 
 
 
239 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  40.53 
 
 
290 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  36.76 
 
 
205 aa  117  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  39.58 
 
 
194 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  40.1 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  39.58 
 
 
194 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  38.54 
 
 
242 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  38.02 
 
 
204 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  38.42 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  40.66 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  40.68 
 
 
195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  40.68 
 
 
195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  40.68 
 
 
195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  33.83 
 
 
207 aa  112  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  40 
 
 
207 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  38.14 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  37.89 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  40.11 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  40.11 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  38.98 
 
 
195 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  34.2 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  39.66 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  38.42 
 
 
204 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  31.16 
 
 
205 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  30.85 
 
 
208 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  37.57 
 
 
211 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  34.25 
 
 
213 aa  105  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  34.54 
 
 
204 aa  105  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0074  hypothetical protein  46.94 
 
 
207 aa  105  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  39.08 
 
 
197 aa  105  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  36.65 
 
 
218 aa  104  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  39.08 
 
 
222 aa  104  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37283  predicted protein  43.89 
 
 
239 aa  104  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118938  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  40 
 
 
303 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  42.24 
 
 
232 aa  103  2e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  40 
 
 
196 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1690  hypothetical protein  35.06 
 
 
172 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.296344  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  40 
 
 
196 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  40 
 
 
303 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  40 
 
 
303 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  34.03 
 
 
200 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3648  hypothetical protein  43.79 
 
 
197 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.987474  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  29.15 
 
 
205 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  34.62 
 
 
198 aa  101  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  39.35 
 
 
197 aa  101  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  38.12 
 
 
212 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  32.26 
 
 
212 aa  100  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  42.34 
 
 
201 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  34.62 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  35.14 
 
 
198 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  40.56 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  34.91 
 
 
210 aa  99.4  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  35.03 
 
 
199 aa  99  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  37.04 
 
 
274 aa  99  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  28.95 
 
 
208 aa  98.6  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  42.51 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  34.05 
 
 
219 aa  96.7  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1667  hypothetical protein  36.21 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.494886  normal  0.674111 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  39.88 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  39.47 
 
 
303 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  34.24 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0046  hypothetical protein  34.51 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  31.52 
 
 
211 aa  95.9  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  31.18 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  36.32 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  38.1 
 
 
212 aa  95.1  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  38.54 
 
 
205 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000121216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  38.54 
 
 
205 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  0.0000831038 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  39.04 
 
 
205 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>