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for query gene PSPA7_0189 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  97.63 
 
 		 211 aa  400  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  68.75 
 
 		 210 aa  305  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  67.79 
 
 		 210 aa  300  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  67.31 
 
 		 210 aa  298  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  67.31 
 
 		 210 aa  298  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  67.31 
 
 		 210 aa  298  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  66.35 
 
 		 211 aa  295  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  62.38 
 
 		 211 aa  276  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  60.87 
 
 		 210 aa  269  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  59.13 
 
 		 210 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  35.53 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  41.32 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  35.82 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  35.29 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  38.06 
 
 		 214 aa  121  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  35.33 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  38.73 
 
 		 226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  34.13 
 
 		 220 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  38.97 
 
 		 207 aa  118  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  42.58 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  39.86 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  40.54 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  40.54 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  40.54 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  40.54 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  39.06 
 
 		 197 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  35.8 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  38.06 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  38.57 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  39.42 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  38.04 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  32.63 
 
 		 214 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  39.44 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  36.41 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  36.65 
 
 		 310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  40.14 
 
 		 191 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  32.84 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  31.05 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  43.2 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  34.76 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  40.62 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  42.55 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  34.24 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  41.35 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  42.55 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  42.55 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  36.54 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  30.53 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  39.44 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  31.43 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 218 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  36.5 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  33.52 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  33.52 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  32.97 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  41.55 
 
 		 217 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  34.3 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  38.03 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  38.03 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  38.03 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  38.03 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  38.03 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  40.16 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  30.6 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  38.03 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  35.71 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 199 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  36.91 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  44.74 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  39.31 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  40.85 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  39.52 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  39.72 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  32.26 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  38.81 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  32.26 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  33.52 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  40.29 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  36.09 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  40.43 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  41.88 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  40.85 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  38.06 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  36.89 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  38.1 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  33.86 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  32.9 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
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NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  34.08 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  35.46 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
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NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  34.08 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
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