83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0159 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  98.81 
 
 
169 aa  328  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  72.02 
 
 
170 aa  249  9.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  51.53 
 
 
184 aa  150  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  49.37 
 
 
167 aa  142  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  45.73 
 
 
171 aa  140  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3010  GPW/gp25 family protein  46.5 
 
 
191 aa  130  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.50496  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  45.68 
 
 
182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  46.2 
 
 
186 aa  124  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  43.4 
 
 
175 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  44.94 
 
 
178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  44.1 
 
 
173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  44.94 
 
 
182 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  43.23 
 
 
184 aa  117  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  44.94 
 
 
186 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  44.94 
 
 
186 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  44.94 
 
 
186 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  44.94 
 
 
186 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  44.94 
 
 
186 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  41.14 
 
 
191 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  45.16 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  40.76 
 
 
183 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  39.38 
 
 
190 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  41.14 
 
 
185 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.49 
 
 
188 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2178  hypothetical protein  38.71 
 
 
193 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0916  hypothetical protein  38.71 
 
 
193 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  38.71 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1203  hypothetical protein  38.71 
 
 
193 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  38.71 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1905  hypothetical protein  38.71 
 
 
193 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0338  hypothetical protein  38.06 
 
 
193 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.06 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  36.94 
 
 
176 aa  91.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.38 
 
 
178 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.82 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0151  hypothetical protein  39.6 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0173  hypothetical protein  39.6 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1622  hypothetical protein  39.6 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.02 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3011  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.18 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0617913  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.02 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.02 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  36.02 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0137  hypothetical protein  36.91 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  37.93 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  37.93 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.42 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  40.15 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  39.42 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  39.42 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  39.42 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  39.42 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  39.42 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  39.42 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.69 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  38.69 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  45.98 
 
 
248 aa  67  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  38.69 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  38.69 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  38.52 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.96 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.96 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  38.52 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  37.23 
 
 
161 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1490  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.79 
 
 
159 aa  60.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.237539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1378  hypothetical protein  31.79 
 
 
159 aa  60.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1930  hypothetical protein  31.79 
 
 
159 aa  60.8  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.180626  normal  0.25956 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  32.85 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2270  hypothetical protein  33.55 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2624  GPW/gp25 family protein  31.16 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  30.56 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3098  hypothetical protein  31.16 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.14 
 
 
182 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  31.06 
 
 
154 aa  52  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2508  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.43 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2766  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.16 
 
 
160 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0113374  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3075  GPW/gp25 family protein  35.11 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3039  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.71 
 
 
183 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3040  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.61 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3029  hypothetical protein  29.19 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0316867  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1210  type VI secretion system lysozyme-related protein  30 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4955  hypothetical protein  28.06 
 
 
160 aa  40.8  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>