More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0115 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  100 
 
 
132 aa  264  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  70.45 
 
 
132 aa  192  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  56 
 
 
135 aa  135  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  53.91 
 
 
134 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  56 
 
 
135 aa  133  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  47.58 
 
 
128 aa  130  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  53.6 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  50.79 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  52.34 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  49.6 
 
 
135 aa  128  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  52.8 
 
 
144 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  52.8 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  53.17 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  52.38 
 
 
144 aa  127  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  52.38 
 
 
144 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  50.41 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  52.38 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  52.38 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  52.38 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  52.38 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  51.2 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  52.38 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  52.38 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  52.38 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  51.59 
 
 
144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  51.2 
 
 
144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
130 aa  124  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  44.35 
 
 
135 aa  123  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  52 
 
 
144 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
135 aa  122  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
135 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  49.21 
 
 
135 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  47.58 
 
 
150 aa  121  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  50 
 
 
135 aa  121  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  49.62 
 
 
137 aa  120  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  49.24 
 
 
135 aa  121  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  47.24 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  48.03 
 
 
141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  46.49 
 
 
116 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  42.4 
 
 
135 aa  106  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  50.38 
 
 
135 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  48 
 
 
167 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  42.4 
 
 
135 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5384  transcriptional regulator, MerR family  47.76 
 
 
149 aa  104  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  46.09 
 
 
173 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
131 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
141 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
147 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  46.46 
 
 
155 aa  100  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  47.2 
 
 
135 aa  100  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  48.72 
 
 
143 aa  100  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  50 
 
 
146 aa  98.6  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
149 aa  98.6  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1623  MerR family transcriptional regulator  47.33 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  40.8 
 
 
130 aa  97.1  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  40 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1620  MerR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230477  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  44.36 
 
 
141 aa  96.7  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  41.6 
 
 
172 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  44.19 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  43.31 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
136 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  42.52 
 
 
133 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4673  transcriptional regulator, MerR family  43.41 
 
 
145 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156077  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.15 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  43.85 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
139 aa  91.3  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  43.85 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
137 aa  88.2  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  40.16 
 
 
157 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  40.16 
 
 
163 aa  87  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
137 aa  87  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
134 aa  86.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
134 aa  86.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
134 aa  86.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
134 aa  86.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  39.37 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  40.16 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  40.46 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  40.46 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  39.37 
 
 
158 aa  84.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>