More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0101 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  100 
 
 
162 aa  294  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  100 
 
 
144 aa  294  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  100 
 
 
144 aa  294  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  100 
 
 
144 aa  294  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  100 
 
 
144 aa  294  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  100 
 
 
144 aa  294  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  93.75 
 
 
144 aa  278  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  93.75 
 
 
144 aa  276  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  93.75 
 
 
144 aa  275  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  92.96 
 
 
151 aa  269  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  96.27 
 
 
144 aa  266  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  94.78 
 
 
144 aa  262  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  94.03 
 
 
144 aa  259  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  91.79 
 
 
144 aa  255  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  91.79 
 
 
144 aa  252  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  77.61 
 
 
136 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  72.93 
 
 
135 aa  201  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  72.93 
 
 
135 aa  201  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  69.92 
 
 
135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  70.15 
 
 
135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  68.89 
 
 
135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  69.17 
 
 
135 aa  188  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  65.19 
 
 
144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  69.17 
 
 
135 aa  187  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  67.67 
 
 
135 aa  184  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
146 aa  177  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
141 aa  156  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  57.94 
 
 
135 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  57.94 
 
 
135 aa  151  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1620  MerR family transcriptional regulator  68.87 
 
 
110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230477  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 
137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  50.4 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  52 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  53.1 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  48.8 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  52.38 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  47.2 
 
 
130 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  42.42 
 
 
135 aa  120  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  48.8 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  49.23 
 
 
131 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  44.36 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
139 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  45.04 
 
 
150 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
135 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
173 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
151 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 
167 aa  99.4  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 
132 aa  99.4  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  47.79 
 
 
142 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  47.79 
 
 
142 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
135 aa  97.1  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  46.4 
 
 
140 aa  97.1  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  41.6 
 
 
130 aa  95.5  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1123  MerR family transcriptional regulator  43.61 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  48.78 
 
 
146 aa  94.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  40.8 
 
 
130 aa  94.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  41.23 
 
 
116 aa  94.4  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  48.36 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  50.5 
 
 
146 aa  92  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  37.31 
 
 
144 aa  91.7  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  37.31 
 
 
141 aa  91.3  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  37.31 
 
 
141 aa  91.3  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  46.15 
 
 
143 aa  90.5  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0060  hypothetical protein  37.59 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.8 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0059  hypothetical protein  36.84 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
141 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
172 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  36.15 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  36.03 
 
 
141 aa  84.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  36.03 
 
 
141 aa  84.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  36.03 
 
 
141 aa  84.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 
141 aa  84.3  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
134 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 
133 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
137 aa  83.6  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1623  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  35.29 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  35.29 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>