30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0097 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0097  site-specific recombinase, phage integrase family protein  100 
 
 
617 aa  1280  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6274  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.76 
 
 
650 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.482293 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5714  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.47 
 
 
650 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6753  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.56 
 
 
650 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4322  hypothetical protein  28.52 
 
 
606 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  26.58 
 
 
616 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3615  site-specific recombinase, phage integrase family  26.82 
 
 
533 aa  188  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455772  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  25.15 
 
 
688 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  24.25 
 
 
600 aa  164  4e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  24.25 
 
 
600 aa  164  4e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1214  phage integrase family protein  33.78 
 
 
236 aa  129  2e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  24.78 
 
 
707 aa  74.3  6e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  23.76 
 
 
683 aa  71.6  4e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  23.76 
 
 
683 aa  71.6  4e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1897  integrase family protein  23.41 
 
 
680 aa  62.4  2e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.17871  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3585  hypothetical protein  29.07 
 
 
289 aa  62.4  2e-08  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3463  integrase family protein  23.41 
 
 
680 aa  62.4  2e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1212  phage integrase family protein  22.25 
 
 
392 aa  61.6  4e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.660438  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  32.62 
 
 
568 aa  60.8  6e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7366  integrase family protein  22.54 
 
 
645 aa  56.6  1e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  23.45 
 
 
624 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  23.45 
 
 
624 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  23.45 
 
 
624 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  23.45 
 
 
624 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  23.45 
 
 
624 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  23.45 
 
 
624 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3931  phage integrase family protein  26.59 
 
 
741 aa  47  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117648  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4742  site-specific recombinase, phage integrase family  36.78 
 
 
682 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0071  site-specific recombinase, phage integrase family protein  21.26 
 
 
700 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4252  phage integrase family protein  23.84 
 
 
694 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000987809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>