More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0094 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  100 
 
 
136 aa  275  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  77.94 
 
 
144 aa  219  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  77.94 
 
 
144 aa  219  1e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  78.36 
 
 
144 aa  218  2e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  77.61 
 
 
144 aa  216  8e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  77.21 
 
 
144 aa  216  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  77.61 
 
 
144 aa  214  3e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  76.47 
 
 
144 aa  214  3e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  77.61 
 
 
162 aa  213  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  5.37327e-08 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  77.61 
 
 
144 aa  213  6e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  77.61 
 
 
144 aa  213  6e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.44936e-13  unclonable  4.3774e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  77.61 
 
 
144 aa  213  6e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  77.61 
 
 
144 aa  213  6e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  77.61 
 
 
144 aa  213  6e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  78.2 
 
 
151 aa  213  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  77.21 
 
 
144 aa  210  6e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  69.92 
 
 
135 aa  196  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  68.89 
 
 
135 aa  195  2e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  69.92 
 
 
135 aa  194  4e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  69.17 
 
 
135 aa  191  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  6.78056e-13  hitchhiker  2.6005e-05 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  69.17 
 
 
135 aa  191  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  69.17 
 
 
135 aa  191  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  69.17 
 
 
135 aa  191  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  63.7 
 
 
136 aa  188  3e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  66.92 
 
 
135 aa  184  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  62.12 
 
 
141 aa  174  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  60.9 
 
 
144 aa  168  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  59.4 
 
 
146 aa  166  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  58.73 
 
 
135 aa  152  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  58.14 
 
 
135 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1620  MerR family transcriptional regulator  70.75 
 
 
110 aa  146  1e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230477  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  49.62 
 
 
137 aa  133  7e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  53.6 
 
 
132 aa  129  1e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  53.98 
 
 
132 aa  129  1e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  52.46 
 
 
132 aa  129  2e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  48 
 
 
128 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  47.2 
 
 
130 aa  119  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
134 aa  120  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  43.65 
 
 
135 aa  119  1e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  44.8 
 
 
135 aa  116  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  47.29 
 
 
131 aa  112  1e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  44.88 
 
 
171 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
151 aa  107  7e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
140 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
135 aa  103  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  43.85 
 
 
150 aa  103  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
142 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
142 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
135 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
173 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 
132 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  4.24023e-06  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 
167 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
139 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1123  MerR family transcriptional regulator  45.04 
 
 
144 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  41.8 
 
 
172 aa  98.6  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  45.11 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  46.51 
 
 
158 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  5.93111e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  46.51 
 
 
158 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 
155 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  1.00878e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  41.23 
 
 
116 aa  95.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  44.36 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.4 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0060  hypothetical protein  37.69 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
134 aa  94  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0059  hypothetical protein  36.92 
 
 
134 aa  93.6  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  36.15 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  36.15 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  36.15 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  40.8 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  40 
 
 
130 aa  92  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1623  MerR family transcriptional regulator  40.46 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  36.09 
 
 
144 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
147 aa  91.3  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  45.61 
 
 
146 aa  90.9  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  44.14 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  39.1 
 
 
136 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  35.38 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  3.30659e-05 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  42.75 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  34.11 
 
 
143 aa  88.2  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
134 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
134 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  36.22 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
134 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
134 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  33.59 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  33.59 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  33.59 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  1.72555e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  33.59 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  33.59 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  33.59 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  33.59 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  33.59 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>