More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0086 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0086  ultraviolet light resistance protein B  100 
 
 		 360 aa  732    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5030  DNA-directed DNA polymerase  51.7 
 
 		 426 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2745  DNA-directed DNA polymerase  48.72 
 
 		 424 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0591  impB/mucB/samB family protein  46.57 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2950  DNA-directed DNA polymerase  48.15 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2158  DNA polymerase V subunit UmuC  48.31 
 
 		 422 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.512063  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2162  DNA polymerase V subunit UmuC  48.03 
 
 		 422 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.229342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1425  DNA-directed DNA polymerase  47.93 
 
 		 426 aa  322  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1965  DNA polymerase V subunit UmuC  48.03 
 
 		 422 aa  320  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000119892  normal  0.867639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2215  DNA polymerase V subunit UmuC  47.75 
 
 		 422 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69246  normal  0.844364 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1671  DNA polymerase V subunit UmuC  47.75 
 
 		 422 aa  318  6e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0525212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1287  DNA polymerase V subunit UmuC  47.75 
 
 		 422 aa  319  6e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000534988  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2212  DNA polymerase V subunit UmuC  46.74 
 
 		 422 aa  318  7.999999999999999e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2606  DNA-directed DNA polymerase  47.46 
 
 		 422 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.4458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2761  DNA-directed DNA polymerase  45.45 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0282343 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01159  DNA polymerase V subunit UmuC  47.47 
 
 		 422 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000022565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2464  DNA-directed DNA polymerase  47.47 
 
 		 422 aa  316  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01169  hypothetical protein  47.47 
 
 		 422 aa  316  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000148835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1329  DNA polymerase V subunit UmuC  47.47 
 
 		 422 aa  316  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2441  DNA polymerase V subunit UmuC  47.47 
 
 		 422 aa  316  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000365295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  46.22 
 
 		 423 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2106  DNA-directed DNA polymerase  44.82 
 
 		 421 aa  289  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0002  DNA polymerase V subunit UmuC  44.8 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1908  DNA-directed DNA polymerase  45.77 
 
 		 420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0036  DNA polymerase V subunit UmuC  44.44 
 
 		 424 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0503759 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1751  umuC protein  44.97 
 
 		 427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4341  DNA-directed DNA polymerase  41.64 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0705  DNA-directed DNA polymerase  41.48 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0053  mutagenesis and repair protein MucB  42.4 
 
 		 421 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000259717  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4268  DNA-repair protein  43.96 
 
 		 382 aa  266  5.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0052  DNA-directed DNA polymerase  43.19 
 
 		 449 aa  263  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154189 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0859  DNA-directed DNA polymerase  42.54 
 
 		 450 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1550  DNA-directed DNA polymerase  42.18 
 
 		 418 aa  256  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0477659 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4000  DNA-directed DNA polymerase  39.94 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1492  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.64 
 
 		 420 aa  253  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00564635  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1369  DNA-directed DNA polymerase  40.8 
 
 		 426 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0886  DNA-directed DNA polymerase  42.7 
 
 		 439 aa  249  5e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0175  DNA-directed DNA polymerase  43.64 
 
 		 423 aa  245  9e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4983  UMUC-like DNA-repair protein  42.66 
 
 		 432 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000315583 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1279  DNA-directed DNA polymerase  45.09 
 
 		 423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2353  DNA-directed DNA polymerase  40.82 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2458  DNA-directed DNA polymerase  40.52 
 
 		 424 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2342  DNA-directed DNA polymerase  40.52 
 
 		 424 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2005  DNA-directed DNA polymerase  40.52 
 
 		 424 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000515421 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1662  hypothetical protein  40.7 
 
 		 418 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1668  hypothetical protein  41.28 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1040  hypothetical protein  37.5 
 
 		 425 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1005  hypothetical protein  36.94 
 
 		 425 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1369  DNA-directed DNA polymerase  38.78 
 
 		 426 aa  229  8e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.772919  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0055  hypothetical protein  36.77 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.352875  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3752  DNA-directed DNA polymerase  41.28 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2200  DNA-directed DNA polymerase  41.5 
 
 		 424 aa  224  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10658  putative RumB/ImpB like DNA repair protein  35.4 
 
 		 422 aa  223  4.9999999999999996e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1966  DNA-directed DNA polymerase  36.01 
 
 		 446 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577995  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  41.36 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6848  DNA-directed DNA polymerase  35.21 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615058  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0459  DNA-directed DNA polymerase  40.74 
 
 		 423 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204967  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3517  DNA-directed DNA polymerase  41.19 
 
 		 478 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0315  DNA-directed DNA polymerase  41.19 
 
 		 443 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.639091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2171  DNA-directed DNA polymerase  34.93 
 
 		 417 aa  216  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3235  DNA-directed DNA polymerase  37.03 
 
 		 418 aa  216  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3210  DNA-directed DNA polymerase  34.89 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000012227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2605  DNA-directed DNA polymerase  36.63 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.733552  normal  0.0235112 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1031  DNA-directed DNA polymerase  37.64 
 
 		 426 aa  212  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0898  DNA-directed DNA polymerase  40.57 
 
 		 437 aa  212  9e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3553  DNA-directed DNA polymerase  36.63 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0759  DNA-directed DNA polymerase  36.42 
 
 		 423 aa  210  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3536  DNA-repair protein  39.82 
 
 		 418 aa  209  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2378  DNA-directed DNA polymerase  38.33 
 
 		 425 aa  208  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2195  DNA-directed DNA polymerase  35.01 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.147122  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2196  DNA-directed DNA polymerase  35.67 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1335  DNA-directed DNA polymerase  40.87 
 
 		 419 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  39.89 
 
 		 442 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4570  DNA-repair protein  39.24 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4598  DNA-repair protein  39.24 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000181511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4414  DNA-repair protein  39.24 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000291737  decreased coverage  0.00359939 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1434  DNA-directed DNA polymerase  40.93 
 
 		 497 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2120  DNA-repair protein  36.55 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0012  SOS mutagenesis protein RulB  35.75 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2682  umuC protein  32.77 
 
 		 418 aa  202  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2344  DNA-directed DNA polymerase  36.23 
 
 		 421 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08269  DNA-directed DNA polymerase  33.88 
 
 		 418 aa  200  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3453  DNA-directed DNA polymerase  33.52 
 
 		 418 aa  199  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00650413  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1832  DNA-repair protein  34.65 
 
 		 418 aa  199  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1636  umuC protein  34.53 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2973  DNA-directed DNA polymerase  39.89 
 
 		 492 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0296388  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2466  DNA-repair protein  36.31 
 
 		 417 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0312138  normal  0.965014 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3075  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.72 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0920  DNA-directed DNA polymerase  38.29 
 
 		 423 aa  192  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.21788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4321  DNA-directed DNA polymerase  36.15 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2040  DNA-directed DNA polymerase  35.39 
 
 		 418 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0886472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1178  DNA-directed DNA polymerase  36.57 
 
 		 424 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0736762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1964  DNA-directed DNA polymerase  34.11 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4498  DNA-directed DNA polymerase  35.38 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15961  putative UmuC protein  37.39 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4407  DNA-directed DNA polymerase  34.55 
 
 		 418 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4268  DNA-directed DNA polymerase  34.55 
 
 		 418 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4172  DNA-directed DNA polymerase  33.71 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.06239 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1292  DNA-directed DNA polymerase  35.51 
 
 		 424 aa  182  6e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.355097  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0220  DNA-directed DNA polymerase  36.78 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>