162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0080 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 466 aa  960    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  51.91 
 
 		 465 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  51.91 
 
 		 469 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  52.33 
 
 		 471 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  52.33 
 
 		 471 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  51.91 
 
 		 472 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  51.91 
 
 		 472 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  51.4 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  50.89 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  44.59 
 
 		 470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  50.26 
 
 		 465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  49.48 
 
 		 465 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  47.07 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  50 
 
 		 458 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  46.08 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  47.27 
 
 		 477 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  44.27 
 
 		 464 aa  360  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  43.13 
 
 		 434 aa  315  9e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  31.03 
 
 		 563 aa  163  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  32.59 
 
 		 586 aa  156  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  32.09 
 
 		 595 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  33 
 
 		 593 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  32.07 
 
 		 574 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  31.53 
 
 		 591 aa  152  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  32.66 
 
 		 559 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  32.58 
 
 		 618 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  32.51 
 
 		 598 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.08 
 
 		 606 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  31.92 
 
 		 582 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.24 
 
 		 593 aa  147  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  30.4 
 
 		 566 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  30.79 
 
 		 593 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  31.53 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  31.53 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  31.53 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  30.56 
 
 		 621 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  30.37 
 
 		 599 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  31.49 
 
 		 574 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  32.24 
 
 		 622 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.82 
 
 		 606 aa  142  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.09 
 
 		 592 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  29.78 
 
 		 626 aa  140  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  31.73 
 
 		 601 aa  140  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  32.8 
 
 		 628 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.25 
 
 		 589 aa  139  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  32.59 
 
 		 569 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  31.06 
 
 		 577 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  31.31 
 
 		 575 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  32.19 
 
 		 565 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  30.17 
 
 		 572 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  33.33 
 
 		 601 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  29.31 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  30.54 
 
 		 594 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  28.11 
 
 		 598 aa  103  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  28.54 
 
 		 583 aa  99.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  27.65 
 
 		 456 aa  97.8  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1868  hypothetical protein  59.7 
 
 		 139 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.776543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3384  hypothetical protein  59.7 
 
 		 139 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  26.51 
 
 		 438 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  24.44 
 
 		 676 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  24.93 
 
 		 588 aa  66.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  23.08 
 
 		 905 aa  64.3  0.000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0432  type III restriction protein res subunit  23.6 
 
 		 619 aa  63.2  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  26.07 
 
 		 531 aa  62.4  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  24.06 
 
 		 590 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  21.48 
 
 		 583 aa  60.1  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  23.8 
 
 		 590 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  24.21 
 
 		 586 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  22.75 
 
 		 590 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6393  type III restriction protein res subunit  24.71 
 
 		 609 aa  57  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  24.14 
 
 		 586 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  21.71 
 
 		 616 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  21.9 
 
 		 995 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  22.54 
 
 		 580 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  24.07 
 
 		 585 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  23.4 
 
 		 494 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  24.32 
 
 		 590 aa  53.5  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  36.84 
 
 		 590 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  22.01 
 
 		 953 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  22.01 
 
 		 953 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  21.87 
 
 		 586 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  23.42 
 
 		 585 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  22.73 
 
 		 580 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  24.4 
 
 		 485 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  26.13 
 
 		 586 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  21.93 
 
 		 584 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  24.17 
 
 		 949 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  23.04 
 
 		 583 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1098  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  23.83 
 
 		 1124 aa  51.2  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  23.28 
 
 		 583 aa  51.2  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  24.08 
 
 		 597 aa  50.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  25.07 
 
 		 586 aa  50.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  25.07 
 
 		 586 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  21.66 
 
 		 584 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  21.58 
 
 		 579 aa  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  24.73 
 
 		 586 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  25.07 
 
 		 586 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 586 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 586 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  25.07 
 
 		 586 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>