244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0077 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  70.79 
 
 
1059 aa  1557  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  83.55 
 
 
1063 aa  1841  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  53.78 
 
 
1081 aa  1140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  45.89 
 
 
1039 aa  879  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  39.44 
 
 
1008 aa  695  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  41.75 
 
 
1007 aa  710  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  45.07 
 
 
905 aa  753  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  42.54 
 
 
1085 aa  785  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  41.64 
 
 
1000 aa  757  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  44.11 
 
 
1039 aa  812  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  42.11 
 
 
1035 aa  798  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  40.81 
 
 
985 aa  644  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  43.09 
 
 
1041 aa  761  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  41.79 
 
 
1073 aa  697  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  45.67 
 
 
1033 aa  821  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  38.58 
 
 
984 aa  662  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  40.41 
 
 
1022 aa  674  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  41.21 
 
 
1078 aa  779  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  38.14 
 
 
1035 aa  689  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  42.62 
 
 
1027 aa  763  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  58.48 
 
 
1052 aa  1224  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  52.19 
 
 
1087 aa  1080  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  43.83 
 
 
1051 aa  798  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  41.67 
 
 
1079 aa  758  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  100 
 
 
1067 aa  2213  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  40.07 
 
 
1029 aa  673  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  49.95 
 
 
1102 aa  1062  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  74.17 
 
 
1060 aa  1640  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  38.28 
 
 
1012 aa  650  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  43.59 
 
 
1009 aa  743  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  73.94 
 
 
1069 aa  1651  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  52.07 
 
 
1112 aa  1117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  38.27 
 
 
1067 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  38.41 
 
 
989 aa  617  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  36.98 
 
 
1009 aa  611  1e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  37.56 
 
 
1004 aa  602  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  36.86 
 
 
1010 aa  597  1e-169  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  37.26 
 
 
1142 aa  598  1e-169  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  38.49 
 
 
965 aa  594  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  35.85 
 
 
992 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  35.95 
 
 
1006 aa  570  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  35.14 
 
 
971 aa  545  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  35.54 
 
 
1023 aa  532  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  35.66 
 
 
1022 aa  529  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  35.62 
 
 
1011 aa  525  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  36.43 
 
 
991 aa  521  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  35.49 
 
 
997 aa  517  1e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  35.71 
 
 
969 aa  514  1e-144  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  35 
 
 
1016 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  34.9 
 
 
999 aa  511  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  33.81 
 
 
1034 aa  473  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  31.98 
 
 
990 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  33.96 
 
 
1002 aa  462  1e-128  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  33.05 
 
 
983 aa  459  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  32.92 
 
 
1023 aa  456  1e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  37.05 
 
 
976 aa  456  1e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  32.76 
 
 
1031 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0040  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.37 
 
 
1032 aa  132  4e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0017  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.8 
 
 
1032 aa  129  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13213  hitchhiker  0.00259353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2911  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.08 
 
 
1079 aa  115  4e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1534  type I restriction-modification enzyme, R subunit  25.31 
 
 
1031 aa  115  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0146067  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4010  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.38 
 
 
1067 aa  114  7e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3131  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.93 
 
 
1060 aa  114  1e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.789076  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1213  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.38 
 
 
1074 aa  114  1e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4244  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.69 
 
 
1084 aa  114  1e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.05 
 
 
1053 aa  113  2e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311039  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0289  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.12 
 
 
1044 aa  113  2e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2251  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.04 
 
 
1044 aa  111  7e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0881  putative type I site specific deoxyribonuclease HsdR  25.04 
 
 
1060 aa  110  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0350782  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0986  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.26 
 
 
1040 aa  108  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1362  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.89 
 
 
1060 aa  107  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4470  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.12 
 
 
1084 aa  107  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.610404 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0616  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.85 
 
 
1024 aa  105  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.945786  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0874  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.2 
 
 
1041 aa  105  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0842  type I restriction-modification enzyme, R subunit  24.01 
 
 
967 aa  105  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156677  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  24.01 
 
 
967 aa  104  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1124  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  25.22 
 
 
1084 aa  104  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.05 
 
 
1042 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175068  normal  0.39911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1944  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.28 
 
 
1034 aa  104  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0380  type I restriction-modification system, R subunit  24.62 
 
 
1033 aa  103  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0504  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  22.42 
 
 
1067 aa  103  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1854  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.96 
 
 
1026 aa  103  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2740  type I restriction-modification system endonuclease  25.59 
 
 
1051 aa  102  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2507  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.12 
 
 
1068 aa  102  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351896  normal  0.319546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0222  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  25.03 
 
 
1028 aa  102  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0939  hypothetical protein  32.46 
 
 
313 aa  102  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.702425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3386  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.03 
 
 
1052 aa  102  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0037  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.28 
 
 
1061 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2662  putative type I restriction enzyme R protein  24.77 
 
 
1076 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.322424  normal  0.707209 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2256  type I restriction-modification system, R subunit  24.06 
 
 
1061 aa  99.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7554  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.72 
 
 
1072 aa  99.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1642  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.04 
 
 
1003 aa  99.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  25.92 
 
 
1022 aa  99.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2413  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.92 
 
 
1022 aa  99.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.623106 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0843  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.62 
 
 
993 aa  99  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2283  Type I site-specific deoxyribonuclease  26.01 
 
 
1044 aa  99  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3013  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.03 
 
 
1070 aa  98.6  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.36517  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4782  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.56 
 
 
1029 aa  99  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1089  type I restriction-modification enzyme, R subunit, putative  26.56 
 
 
1040 aa  99  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17680  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.2 
 
 
1035 aa  98.2  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>