194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0076 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  100 
 
 		 464 aa  957    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  84.86 
 
 		 448 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.95 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  39.57 
 
 		 429 aa  261  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  35.86 
 
 		 461 aa  259  8e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.43 
 
 		 427 aa  239  9e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  33.98 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  36.77 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  34.69 
 
 		 487 aa  226  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  32.49 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  31.42 
 
 		 456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  34.49 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  30.56 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  33.69 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  32.14 
 
 		 436 aa  205  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  31.91 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.5 
 
 		 453 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  33.33 
 
 		 431 aa  192  8e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.3 
 
 		 462 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  33.54 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  36.16 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  32.27 
 
 		 429 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  30.32 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  30.2 
 
 		 413 aa  169  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  28.54 
 
 		 432 aa  169  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.2 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  30.46 
 
 		 474 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  29.22 
 
 		 474 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  29.28 
 
 		 451 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.41 
 
 		 441 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  29.36 
 
 		 429 aa  162  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  27.31 
 
 		 422 aa  157  6e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  30.02 
 
 		 416 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  28.74 
 
 		 419 aa  152  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  28.54 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  27.73 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3777  restriction endonuclease S subunits-like protein  28.23 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3850  restriction endonuclease S subunits-like protein  28.23 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  26.25 
 
 		 463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  26.54 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  28.11 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  26.05 
 
 		 461 aa  126  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  25.16 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  30.61 
 
 		 425 aa  124  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  26.88 
 
 		 458 aa  124  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  26.74 
 
 		 462 aa  123  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.72 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  23.75 
 
 		 446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  24.73 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  25.54 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01116  hypothetical protein  32.84 
 
 		 400 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  31.79 
 
 		 400 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  23.44 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.26 
 
 		 473 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  25.34 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  31.4 
 
 		 267 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  28.26 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  24.42 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.84 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  22.54 
 
 		 439 aa  103  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  23.93 
 
 		 425 aa  103  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13680  hypothetical protein  27.16 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.247083  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1366  putative type I site-specific restriction-modification system, S subunit  26.67 
 
 		 422 aa  94.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0493853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  25 
 
 		 477 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4917  restriction modification system DNA specificity subunit  23.99 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.544675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0564  restriction modification system DNA specificity subunit  25.39 
 
 		 415 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00017151  decreased coverage  6.20122e-17 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  22.22 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  27.87 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  27.87 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  25.16 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  29.19 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4455  restriction modification system DNA specificity subunit  24.62 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.353509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  20.05 
 
 		 444 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  24.53 
 
 		 402 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  25.74 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  24.02 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  24.44 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  25.98 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  22.15 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  25.17 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  25.18 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  24.03 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2960  restriction modification system DNA specificity subunit  22.39 
 
 		 587 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  25 
 
 		 409 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  27.75 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0727  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.3 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0968972 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1890  type I restriction-modification system, S subunit  23.33 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  23.62 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  21.46 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  26.26 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  21.15 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3649  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.26 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  21.8 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  22.98 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.19 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  21.63 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  20.18 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  21.77 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.08 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.49 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>