31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0063 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0063  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  672  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00750  hypothetical protein  97.52 
 
 
375 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0093  hypothetical protein  68.15 
 
 
376 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0146  hypothetical protein  69.42 
 
 
351 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0093  hypothetical protein  69.55 
 
 
387 aa  466  1e-130  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0108  hypothetical protein  69.49 
 
 
363 aa  460  1e-128  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0043  hypothetical protein  68.2 
 
 
351 aa  459  1e-128  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0111  hypothetical protein  68.37 
 
 
363 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163649  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0108  hypothetical protein  67.67 
 
 
357 aa  452  1e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.75774e-05 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4455  aminopeptidase-like protein  64.33 
 
 
353 aa  417  1e-115  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01150  hypothetical protein  61.61 
 
 
355 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2999  putative zinc protease protein  48.97 
 
 
379 aa  307  2e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3150  putative zinc protease protein  48.96 
 
 
385 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2858  putative zinc protease protein  49.25 
 
 
384 aa  295  9e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3105  putative zinc protease protein  46.45 
 
 
365 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2740  putative zinc protease protein  46.65 
 
 
365 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0331505  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3087  putative zinc protease protein  47.62 
 
 
363 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0536  putative zinc protease protein  46.33 
 
 
385 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.421159  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3380  putative zinc protease protein  43.95 
 
 
357 aa  254  2e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4033  putative zinc protease protein  44.25 
 
 
369 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.213397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3556  putative zinc protease protein  40.3 
 
 
356 aa  235  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3501  putative zinc protease protein  43.53 
 
 
374 aa  233  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0403427  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3534  putative zinc protease protein  42.82 
 
 
360 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0447  putative zinc protease protein  43.34 
 
 
381 aa  222  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.400718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0456  putative zinc protease protein  43.06 
 
 
381 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0774  putative zinc protease protein  44.02 
 
 
399 aa  213  5e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0866721  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0337  putative zinc protease protein  43.36 
 
 
384 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1145  putative zinc protease protein  39.95 
 
 
442 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5834  aminopeptidase  34.81 
 
 
349 aa  135  1e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.325368  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0004  aminopeptidase  29.43 
 
 
340 aa  118  1e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0290521  normal  0.0636966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0009  aminopeptidase  35.14 
 
 
343 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  7.16532e-07  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>