20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0061 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0061  putative lipoprotein  100 
 
 
145 aa  290  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00730  hypothetical protein  97.93 
 
 
145 aa  247  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0150  lipoprotein, putative  47.73 
 
 
144 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0042  putative lipoprotein  48.87 
 
 
162 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0106  hypothetical protein  50.4 
 
 
137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0106  lipoprotein  50.4 
 
 
137 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000139404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0109  lipoprotein  49.6 
 
 
137 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.655067  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0091  putative lipoprotein  49.6 
 
 
137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0095  putative lipoprotein  50.42 
 
 
139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4454  hypothetical protein  44.72 
 
 
139 aa  102  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01170  hypothetical protein  45.9 
 
 
138 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2584  lipoprotein  45.11 
 
 
140 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.968594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0110  lipoprotein  33.06 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604629  normal  0.0221205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0094  putative lipoprotein  37.3 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0107  hypothetical protein  36.79 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0107  lipoprotein  32.81 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0092  putative lipoprotein  35.85 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01160  hypothetical protein  36.75 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00740  putative lipoprotein  34.19 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0062  putative lipoprotein  34.19 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
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