56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0054 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0054  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  100 
 
 
182 aa  360  8e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00660  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  92.31 
 
 
182 aa  316  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1795  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  65.12 
 
 
194 aa  217  9e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04200  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  58.99 
 
 
184 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  3.93415e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3665  Phosphate acetyltransferase  58.99 
 
 
184 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  5.62336e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  58.99 
 
 
184 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04163  hypothetical protein  58.99 
 
 
184 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  2.25053e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4875  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  58.43 
 
 
194 aa  214  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4559  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  58.43 
 
 
184 aa  214  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4774  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  58.99 
 
 
184 aa  214  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0381  phosphotransferase KptA/Tpt1  58.14 
 
 
186 aa  213  1e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4788  RNA 2'-phosphotransferase  53.07 
 
 
187 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6764  phosphate acetyltransferase  55.31 
 
 
211 aa  201  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534993  normal  0.870017 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0438  phosphotransferase KptA/Tpt1  53.04 
 
 
180 aa  198  4e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1806  phosphate acetyltransferase  57.31 
 
 
179 aa  180  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.825619  normal  0.0231057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0075  phosphotransferase KptA/Tpt1  47.78 
 
 
180 aa  177  6e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0748  phosphate acetyltransferase  45.81 
 
 
182 aa  168  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.325809  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4048  phosphotransferase KptA/Tpt1  47.06 
 
 
182 aa  165  3e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.624394  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2545  RNA 2'-phosphotransferase  46.47 
 
 
195 aa  164  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5352  phosphotransferase KptA/Tpt1  50.28 
 
 
182 aa  164  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.74919  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5513  putative RNA 2'-phosphotransferase  54.75 
 
 
187 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0209017  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3205  phosphotransferase KptA/Tpt1  50.59 
 
 
184 aa  157  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  hitchhiker  3.38046e-10 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2868  phosphate acetyltransferase  48.52 
 
 
181 aa  156  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.784433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5516  Phosphate acetyltransferase  48.84 
 
 
180 aa  154  5e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.16983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5760  phosphate acetyltransferase  55.84 
 
 
394 aa  154  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0192173  hitchhiker  4.62587e-14 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2734  phosphotransferase KptA/Tpt1  48.89 
 
 
180 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0177  phosphotransferase KptA/Tpt1  49.72 
 
 
177 aa  148  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342477  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0145  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  41.86 
 
 
186 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.71719  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4889  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  47.37 
 
 
182 aa  148  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0729  phosphotransferase KptA/Tpt1  40.59 
 
 
192 aa  148  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0143  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  41.28 
 
 
186 aa  147  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.264895  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3135  phosphotransferase KptA/Tpt1  40.83 
 
 
180 aa  147  1e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2451  phosphotransferase KptA/Tpt1  51.43 
 
 
176 aa  145  4e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  hitchhiker  2.61836e-07 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04510  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  43.58 
 
 
180 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350174  hitchhiker  2.75449e-06 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1928  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  45.76 
 
 
184 aa  134  7e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507993  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4639  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  44.12 
 
 
182 aa  133  1e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  4.60049e-10  normal  0.20738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5718  phosphotransferase KptA/Tpt1  44.2 
 
 
174 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2137  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  43.33 
 
 
184 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0213319  normal  0.0608547 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18720  RNA:NAD 2'-phosphotransferase  43.92 
 
 
215 aa  128  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.635673  normal  0.289098 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3059  phosphotransferase KptA/Tpt1  41.38 
 
 
182 aa  125  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0018  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  38.12 
 
 
209 aa  107  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.840157  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0931  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  38.33 
 
 
209 aa  106  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2777  RNA 2'-phosphotransferase  35.52 
 
 
185 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61899e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1549  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  38.55 
 
 
216 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1047  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  36.11 
 
 
211 aa  98.2  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.376567  normal  0.793229 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0908  phosphotransferase KptA/Tpt1  36 
 
 
253 aa  95.5  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2307  phosphotransferase KptA/Tpt1  37.29 
 
 
201 aa  95.5  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.545628  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0527  phosphotransferase KptA/Tpt1  40.38 
 
 
225 aa  85.5  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1765  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  31.69 
 
 
216 aa  84.7  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0962  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  30.6 
 
 
207 aa  80.9  9e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1409  RNA 2'-phosphotransferase-like protein  32.35 
 
 
215 aa  73.2  2e-12  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4144  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like  54.69 
 
 
106 aa  63.2  2e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00880983  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4222  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like protein  54.69 
 
 
83 aa  62.4  4e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0385  RNA:NAD 2'-phosphotransferase-like protein  65 
 
 
46 aa  57.8  8e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1544  phosphotransferase KptA/Tpt1  26.37 
 
 
253 aa  48.1  7e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00427558  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21228  predicted protein  25.87 
 
 
225 aa  42  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>