67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0051 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0051  putative transcriptional regulator  100 
 
 
138 aa  275  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00600  putative transcriptional regulator  76.38 
 
 
127 aa  196  1e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1953  normal  0.198014 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
142 aa  50.4  8e-06  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
137 aa  50.4  8e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
380 aa  47.4  6e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  26.04 
 
 
163 aa  47  8e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
300 aa  47  9e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  3.32957e-11  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  38.33 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  38.33 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1213  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
394 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00829806  decreased coverage  4.99416e-05 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  27.85 
 
 
206 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
231 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  29.07 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
196 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  32.88 
 
 
252 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.60527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
273 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2421  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195917  normal  0.223738 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0762  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 
205 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  34.85 
 
 
132 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.08423e-06 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  32.08 
 
 
374 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  32.91 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  33.96 
 
 
374 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  6.79525e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 
490 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  34.29 
 
 
436 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  37.74 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  32.91 
 
 
259 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0763  transcriptional regulator  33.33 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.305784 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  26.85 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  23.38 
 
 
244 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2143  helix-turn-helix domain protein  38.18 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  37.1 
 
 
200 aa  41.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  30.3 
 
 
352 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 
364 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 
181 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 
100 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  28.57 
 
 
240 aa  42  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
133 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  30.19 
 
 
242 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  28.97 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  28.97 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  32.26 
 
 
369 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  27.42 
 
 
374 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  26.58 
 
 
281 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  7.86405e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.59518e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 
117 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  29.73 
 
 
262 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  33.33 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 
262 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  32.35 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  30.91 
 
 
122 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.61389e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  2.12762e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  27.1 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>