44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0041 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0041  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  150  6e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00480  hypothetical protein  98.67 
 
 
75 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0038  hypothetical protein  68.92 
 
 
74 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0154  hypothetical protein  66.22 
 
 
74 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0099  hypothetical protein  68.92 
 
 
74 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0105  hypothetical protein  70.27 
 
 
73 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0087  hypothetical protein  62.67 
 
 
87 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0102  hypothetical protein  64.86 
 
 
73 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.05882e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0102  hypothetical protein  64.86 
 
 
73 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0108  hypothetical protein  60 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72225  hitchhiker  0.00358532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4456  hypothetical protein  57.33 
 
 
76 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0090  hypothetical protein  60 
 
 
98 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0105  hypothetical protein  60 
 
 
77 aa  82.8  2e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.14235e-06 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0105  hypothetical protein  58.67 
 
 
77 aa  82  2e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0041  hypothetical protein  58.9 
 
 
77 aa  80.9  5e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0151  hypothetical protein  54.67 
 
 
77 aa  77.8  5e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01140  hypothetical protein  66.07 
 
 
99 aa  76.3  1e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.147153  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00720  hypothetical protein  52 
 
 
77 aa  75.5  2e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0096  hypothetical protein  54.55 
 
 
79 aa  75.9  2e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0060  hypothetical protein  52 
 
 
77 aa  73.9  6e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3604  hypothetical protein  50.72 
 
 
122 aa  62.4  2e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.476197  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3978  protein of unknown function DUF1161  45.83 
 
 
110 aa  60.8  6e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.234117  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2124  hypothetical protein  38.71 
 
 
140 aa  51.6  4e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1866  putative lipoprotein  42.67 
 
 
81 aa  50.4  9e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.380587  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1978  hypothetical protein  42.67 
 
 
81 aa  50.4  9e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2348  protein of unknown function DUF1161  42.67 
 
 
99 aa  50.1  1e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0734587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2047  hypothetical protein  44 
 
 
99 aa  48.9  2e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.58796  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1926  hypothetical protein  39.24 
 
 
101 aa  47.8  6e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704459  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1670  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  47  9e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1602  putative outer membrane protein  44.44 
 
 
101 aa  47  9e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.985432 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1672  putative outer membrane protein  44.44 
 
 
101 aa  47  9e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.147833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1839  putative outer membrane protein  44.44 
 
 
101 aa  47  9e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.549082  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1611  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  47  9e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1772  hypothetical protein  40.74 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2057  protein of unknown function DUF1161  40.74 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.927614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01545  hypothetical protein  40.74 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01555  hypothetical protein  40.74 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.41179  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1659  hypothetical protein  40.74 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1793  hypothetical protein  40.74 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2044  hypothetical protein  40.74 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1614  hypothetical protein  40.74 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2295  hypothetical protein  40.74 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  2.98038e-08 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2287  hypothetical protein  46.3 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.581358  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4628  hypothetical protein  37.5 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.217828  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>