44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0035 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0035  dopa 4,5-dioxygenase  100 
 
 
125 aa  259  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00410  putative dioxygenase  88.8 
 
 
125 aa  241  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0096  DOPA 45-dioxygenase  69.81 
 
 
110 aa  171  3e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.00546e-08 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0029  hypothetical protein  70.48 
 
 
108 aa  170  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.313279  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0099  DOPA 45-dioxygenase  67.92 
 
 
110 aa  169  8e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  5.61986e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0081  hypothetical protein  67.92 
 
 
123 aa  169  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  0.000339661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0096  DOPA 4,5-dioxygenase  68.87 
 
 
110 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0163  hypothetical protein  61.9 
 
 
110 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233913  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2138  Dopa 45-dioxygenase  51.75 
 
 
116 aa  136  9e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1425  DOPA 45-dioxygenase  47.75 
 
 
120 aa  123  8e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.509648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1678  hypothetical protein  49.57 
 
 
117 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1688  Dopa 45-dioxygenase  52.94 
 
 
115 aa  117  4e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2245  hypothetical protein  49.57 
 
 
117 aa  116  8e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.68606  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3138  hypothetical protein  52.94 
 
 
124 aa  116  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.471828  decreased coverage  0.00930888 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1270  hypothetical protein  48.7 
 
 
117 aa  113  1e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0983  hypothetical protein  48.7 
 
 
117 aa  113  1e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.917936  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2932  hypothetical protein  48.7 
 
 
117 aa  113  1e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2658  DOPA-dioxygenase-like  45.28 
 
 
120 aa  112  1e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2245  hypothetical protein  48.7 
 
 
117 aa  113  1e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1288  DOPA 4,5-dioxygenase  48.7 
 
 
117 aa  113  1e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3057  hypothetical protein  48.7 
 
 
117 aa  113  1e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1964  hypothetical protein  48.7 
 
 
117 aa  113  1e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0224  putative dioxygenase  51.35 
 
 
116 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3249  DOPA 45-dioxygenase  45.22 
 
 
117 aa  106  9e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5451  DOPA 45-dioxygenase  51.4 
 
 
112 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0418054 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2621  hypothetical protein  44.76 
 
 
111 aa  103  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4881  aromatic ring-cleaving dioxygenase-like protein  43.48 
 
 
117 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290498  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7107  Dopa 45-dioxygenase  46.3 
 
 
116 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878058  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0102  aromatic ring-cleaving dioxygenase-like  43.48 
 
 
136 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5429  DOPA 45-dioxygenase  42.61 
 
 
117 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5303  aromatic ring-cleaving dioxygenase-like protein  43.48 
 
 
117 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118492  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4715  DOPA 45-dioxygenase  43.48 
 
 
117 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5557  aromatic ring-cleaving dioxygenase-like protein  43.48 
 
 
117 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0838  hypothetical protein  38.3 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.457357  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3645  Dopa 45-dioxygenase  38.53 
 
 
246 aa  84.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.177178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3216  hypothetical protein  39.64 
 
 
132 aa  82.8  1e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2296  Dopa 45-dioxygenase  40.35 
 
 
142 aa  79  2e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.109564 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04806  conserved hypothetical protein  41.88 
 
 
188 aa  76.6  1e-13  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.612682 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001586  aromatic ring-cleaving dioxygenase  38.61 
 
 
106 aa  59.7  1e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30848  predicted protein  30.65 
 
 
178 aa  60.1  1e-08  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.91244 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05556  4,5-dioxygenase  33.03 
 
 
106 aa  56.2  2e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0614  aromatic ring-cleaving dioxygenase-like protein  33.65 
 
 
143 aa  54.7  4e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.412688  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0315  hypothetical protein  38.68 
 
 
109 aa  54.3  5e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29052  predicted protein  26.55 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>