23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0028 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00310  putative peptidyl-prolyl isomerase  86.68 
 
 
428 aa  710  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0028  putative lipoprotein  100 
 
 
428 aa  839  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3588  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.57 
 
 
300 aa  63.5  7e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  9.61276e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0215  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.14 
 
 
324 aa  57.4  5e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  3.67752e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0198  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.84 
 
 
336 aa  57.4  5e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54337e-14 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3548  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.62 
 
 
323 aa  54.3  4e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.37747e-11  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0016  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  27.43 
 
 
313 aa  53.9  6e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000161985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0729  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.13 
 
 
314 aa  52.8  1e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0141  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.88 
 
 
310 aa  50.8  5e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.69336e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0887  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  20.92 
 
 
249 aa  49.3  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0142655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1512  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.5 
 
 
355 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00064667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0699  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.91 
 
 
305 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.2571e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1087  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D  29.01 
 
 
618 aa  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0366769  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1730  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.41 
 
 
289 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1207  peptidylprolyl isomerase  30 
 
 
287 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1145  peptidylprolyl isomerase  26.67 
 
 
287 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0952  peptidylprolyl isomerase  26.67 
 
 
287 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2399  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.23 
 
 
261 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110664  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0583  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 
667 aa  43.5  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  5.01806e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0659  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.42 
 
 
324 aa  43.5  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3100  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 
341 aa  43.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1221  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.39 
 
 
308 aa  43.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0385  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  19.87 
 
 
270 aa  43.1  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>