39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0015 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0015  TPR domain-containing protein  100 
 
 
104 aa  206  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00160  TPR repeat-containing protein  86.54 
 
 
105 aa  181  2e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0051  TPR repeat-containing protein  77.45 
 
 
104 aa  159  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0013  hypothetical protein  75.96 
 
 
104 aa  157  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540742  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0083  TPR repeat-containing protein  74.51 
 
 
102 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  hitchhiker  1.63177e-08 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46510  hypothetical protein  73.27 
 
 
107 aa  148  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0247352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0080  tetratricopeptide domain-containing protein  72.55 
 
 
102 aa  145  1e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.163561  hitchhiker  7.57426e-12 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0080  TPR repeat-containing protein  71.57 
 
 
104 aa  143  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0064  TPR domain-containing protein  71.57 
 
 
104 aa  143  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  3.02311e-07 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2284  TPR repeat-containing protein  65 
 
 
112 aa  124  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0435427  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0023  TPR repeat-containing protein  55 
 
 
111 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.727906  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0204  TPR repeat-containing protein  52.48 
 
 
110 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0438861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  52.48 
 
 
108 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  6.06003e-08 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4712  hypothetical protein  53.47 
 
 
108 aa  89.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.658591  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2621  TPR repeat-containing protein  46.6 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2265  TPR repeat-containing protein  43.88 
 
 
112 aa  71.6  3e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.073962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  34.34 
 
 
111 aa  65.1  4e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
109 aa  55.1  3e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01282  glutamine-rich cytoplasmic protein (Eurofung)  29.41 
 
 
347 aa  45.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.271193 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 
436 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1254  tetratricopeptide TPR_2  35.9 
 
 
260 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.146515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
605 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.56395e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  37.25 
 
 
561 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43936  antiviral protein  36.84 
 
 
1413 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3254  hypothetical protein  27.47 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
461 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
827 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 
330 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2246  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 
252 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353905 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.26 
 
 
557 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.72 
 
 
384 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  32.29 
 
 
267 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.43988e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30 
 
 
935 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
318 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.88 
 
 
626 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
1092 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  36.36 
 
 
396 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  25.27 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>