109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0013 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0013  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00140  hypothetical protein  94.44 
 
 
217 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0050  hypothetical protein  76.7 
 
 
216 aa  317  8e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1936  hypothetical protein  66.99 
 
 
224 aa  278  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2279  hypothetical protein  60.29 
 
 
223 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002094  putative preQ0 transporter  60.77 
 
 
245 aa  261  7e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00342  hypothetical protein  60.77 
 
 
224 aa  260  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2235  hypothetical protein  65.64 
 
 
222 aa  258  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2745  hypothetical protein  64.65 
 
 
222 aa  256  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0268522  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  61.31 
 
 
221 aa  255  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3891  hypothetical protein  61.31 
 
 
221 aa  255  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  61.93 
 
 
246 aa  254  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  57.41 
 
 
221 aa  253  1e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  57.41 
 
 
221 aa  253  1e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3781  hypothetical protein  61.31 
 
 
221 aa  253  1e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3951  hypothetical protein  61.31 
 
 
221 aa  253  1e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0226  hypothetical protein  58.49 
 
 
221 aa  253  2e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  62.31 
 
 
223 aa  253  2e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.85366e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  60.8 
 
 
221 aa  252  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3883  hypothetical protein  62 
 
 
223 aa  252  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4070  hypothetical protein  62.44 
 
 
222 aa  252  4e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  56.94 
 
 
221 aa  251  7e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  56.94 
 
 
221 aa  251  7e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  56.94 
 
 
221 aa  251  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  56.94 
 
 
221 aa  251  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  56.94 
 
 
221 aa  251  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  56.94 
 
 
221 aa  251  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0245  hypothetical protein  56.94 
 
 
221 aa  250  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0128  hypothetical protein  59.91 
 
 
219 aa  250  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00134236  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  62.77 
 
 
222 aa  250  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0231  hypothetical protein  59.31 
 
 
222 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0569  hypothetical protein  59.31 
 
 
222 aa  246  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3987  hypothetical protein  59.31 
 
 
222 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0191  hypothetical protein  57.89 
 
 
227 aa  245  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2628  hypothetical protein  58.65 
 
 
219 aa  244  7e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0091  hypothetical protein  56.34 
 
 
225 aa  244  1e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0214  hypothetical protein  56.07 
 
 
219 aa  243  2e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3914  hypothetical protein  56.02 
 
 
226 aa  243  2e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4090  hypothetical protein  60.5 
 
 
219 aa  241  7e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  55.29 
 
 
221 aa  239  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0204  hypothetical protein  58.38 
 
 
221 aa  239  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4313  hypothetical protein  57.21 
 
 
219 aa  239  3e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.98941e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0086  hypothetical protein  57.21 
 
 
219 aa  239  3e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.084364  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4453  hypothetical protein  57.21 
 
 
219 aa  239  3e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00367803  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4258  hypothetical protein  57.21 
 
 
219 aa  239  3e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  9.18531e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0086  hypothetical protein  55.77 
 
 
225 aa  238  6e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.106131  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  58.59 
 
 
219 aa  238  7e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  58.59 
 
 
217 aa  236  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  4.80386e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  58.59 
 
 
217 aa  236  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  6.81461e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  58.59 
 
 
217 aa  236  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.80741e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  58.08 
 
 
219 aa  236  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0541  hypothetical protein  56.65 
 
 
236 aa  229  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0322  hypothetical protein  47.28 
 
 
225 aa  172  3e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0305  hypothetical protein  47.28 
 
 
225 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0027  hypothetical protein  37.11 
 
 
208 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2665  hypothetical protein  38.22 
 
 
210 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0023  hypothetical protein  45.77 
 
 
208 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2296  hypothetical protein  38.64 
 
 
181 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0878915  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  37.81 
 
 
207 aa  97.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0352  hypothetical protein  36.46 
 
 
186 aa  95.5  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  0.803247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3880  hypothetical protein  33.03 
 
 
211 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0764274 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4043  hypothetical protein  33.18 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3587  hypothetical protein  32.58 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492046  normal  0.202587 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1365  hypothetical protein  42.96 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0033  hypothetical protein  42.96 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2557  hypothetical protein  33.93 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216899  normal  0.863189 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0078  hypothetical protein  34.47 
 
 
220 aa  87  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1938  hypothetical protein  33.66 
 
 
223 aa  85.9  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  32.22 
 
 
216 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2014  hypothetical protein  33.66 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.736236  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3073  hypothetical protein  35.24 
 
 
208 aa  84.3  1e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2662  hypothetical protein  33.16 
 
 
204 aa  83.6  2e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  35.23 
 
 
189 aa  82  6e-15  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  32.26 
 
 
235 aa  62.4  5e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  31.21 
 
 
235 aa  62  6e-09  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  32.32 
 
 
228 aa  60.1  3e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  29.1 
 
 
185 aa  57.8  1e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  29.38 
 
 
235 aa  56.6  3e-07  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  25.65 
 
 
266 aa  55.1  7e-07  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  31.41 
 
 
236 aa  54.3  1e-06  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  27.33 
 
 
228 aa  53.1  3e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  27.72 
 
 
230 aa  53.1  3e-06  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  29.94 
 
 
224 aa  51.2  1e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  30.23 
 
 
229 aa  50.4  2e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  30 
 
 
207 aa  50.1  2e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  28.04 
 
 
258 aa  50.4  2e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  27.03 
 
 
234 aa  50.8  2e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  6.6201e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  25.13 
 
 
262 aa  50.4  2e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  25.62 
 
 
233 aa  50.1  2e-05  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  26.97 
 
 
234 aa  48.5  7e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  28.05 
 
 
208 aa  48.5  7e-05  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  26.97 
 
 
234 aa  48.5  7e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  28.67 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  28.85 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  29.51 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  25.49 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  29.51 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  28.57 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  30.58 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  26.4 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>