More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5142 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
268 aa  538  1e-152  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  95.15 
 
 
269 aa  515  1e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  95.9 
 
 
268 aa  516  1e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  95.9 
 
 
268 aa  516  1e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  90.8 
 
 
271 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  84.33 
 
 
270 aa  467  1e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  84.33 
 
 
270 aa  469  1e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  78.73 
 
 
266 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  78.65 
 
 
266 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  78.65 
 
 
266 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  78.63 
 
 
265 aa  424  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  61.19 
 
 
270 aa  339  3e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  61.45 
 
 
262 aa  329  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.15 
 
 
269 aa  327  1e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.08 
 
 
262 aa  326  2e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.79 
 
 
265 aa  317  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.63 
 
 
261 aa  314  8e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.25 
 
 
261 aa  313  2e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1415  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  61.9 
 
 
248 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60 
 
 
267 aa  308  5e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.98 
 
 
283 aa  306  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.81 
 
 
256 aa  306  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.81 
 
 
256 aa  305  5e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.43 
 
 
263 aa  302  4e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.18 
 
 
290 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.49 
 
 
261 aa  295  5e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.77 
 
 
271 aa  295  6e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.22 
 
 
265 aa  294  9e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.87 
 
 
267 aa  294  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.06 
 
 
267 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.56 
 
 
271 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3397  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.28 
 
 
289 aa  291  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.38 
 
 
273 aa  291  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.85 
 
 
273 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.93 
 
 
290 aa  289  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.93 
 
 
290 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.93 
 
 
290 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.14 
 
 
280 aa  288  7e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.06 
 
 
290 aa  287  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.93 
 
 
289 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0592  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.54 
 
 
280 aa  283  2e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  8.01291e-07  unclonable  2.22313e-18 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1450  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.35 
 
 
301 aa  283  2e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.34 
 
 
276 aa  283  3e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.7 
 
 
287 aa  282  3e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.02 
 
 
287 aa  282  4e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.35 
 
 
287 aa  281  6e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.83 
 
 
270 aa  281  7e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.01 
 
 
301 aa  280  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.642612  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.08 
 
 
285 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04650  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.9 
 
 
296 aa  279  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0706142  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.2 
 
 
275 aa  279  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0661  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.17 
 
 
295 aa  274  1e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3148  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.94 
 
 
291 aa  273  2e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.98602e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4094  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.94 
 
 
291 aa  273  2e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00562509  normal  0.0603079 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.94 
 
 
291 aa  273  2e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00174418  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.94 
 
 
291 aa  273  2e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.115465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0887  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.94 
 
 
291 aa  273  2e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2975  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.94 
 
 
291 aa  273  2e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00678242  normal  0.0109979 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0863  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.94 
 
 
291 aa  273  2e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00349665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02637  hypothetical protein  48.94 
 
 
291 aa  273  2e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3034  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.94 
 
 
291 aa  273  2e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0527385  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3215  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
291 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.023751 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3329  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
291 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985131 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0571  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.69 
 
 
266 aa  273  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3149  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
291 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3229  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.65 
 
 
291 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228705 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3166  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.65 
 
 
291 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0961486  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.89 
 
 
289 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.37 
 
 
268 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.99 
 
 
268 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2330  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.47 
 
 
292 aa  269  3e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.486837 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0703  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.65 
 
 
294 aa  269  3e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.609213 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.61 
 
 
268 aa  270  3e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.61 
 
 
268 aa  270  3e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.26 
 
 
264 aa  268  6e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.61 
 
 
268 aa  268  9e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.85 
 
 
269 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.85 
 
 
269 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2010  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.3 
 
 
294 aa  266  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.85 
 
 
269 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0543  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.03 
 
 
285 aa  266  2e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0349  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.09 
 
 
274 aa  266  3e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3270  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.46 
 
 
290 aa  266  3e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.89 
 
 
270 aa  266  3e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.16 
 
 
296 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.48 
 
 
269 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.22 
 
 
268 aa  265  8e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.48 
 
 
296 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.48 
 
 
296 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.48 
 
 
296 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.48 
 
 
296 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.48 
 
 
296 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1342  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.59 
 
 
294 aa  265  8e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.48 
 
 
296 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.48 
 
 
296 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.8 
 
 
296 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2410  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.97 
 
 
303 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.8 
 
 
296 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.27 
 
 
263 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.11 
 
 
301 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>