226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5068 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1111    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5028  hypothetical protein  77 
 
 		 487 aa  768    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0494  hypothetical protein  77.41 
 
 		 487 aa  771    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0444  hypothetical protein  77.62 
 
 		 487 aa  758    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734273  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  96.71 
 
 		 486 aa  975    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5760  hypothetical protein  75.93 
 
 		 486 aa  721    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  69.61 
 
 		 487 aa  672    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  98.77 
 
 		 486 aa  993    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  78.44 
 
 		 487 aa  773    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66410  hypothetical protein  75.31 
 
 		 486 aa  722    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  95.06 
 
 		 486 aa  956    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  52.47 
 
 		 489 aa  498  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  50.91 
 
 		 488 aa  480  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  51.54 
 
 		 489 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  51.12 
 
 		 492 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  51.46 
 
 		 483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  49.9 
 
 		 521 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  50.88 
 
 		 518 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  50.88 
 
 		 518 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  50.1 
 
 		 525 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  49.71 
 
 		 525 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  51.26 
 
 		 483 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  50.61 
 
 		 522 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  51.28 
 
 		 480 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  49.71 
 
 		 525 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  49.71 
 
 		 525 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  49.71 
 
 		 521 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  50.2 
 
 		 522 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  50.4 
 
 		 540 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  49.71 
 
 		 521 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  50 
 
 		 522 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  50 
 
 		 522 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  50 
 
 		 487 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  50.6 
 
 		 508 aa  458  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  51.14 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  50 
 
 		 483 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  49.38 
 
 		 480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  48.04 
 
 		 485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  49.38 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  49.38 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  49.17 
 
 		 480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  49.17 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  49.39 
 
 		 522 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  49.39 
 
 		 522 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  50.4 
 
 		 525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  48.75 
 
 		 521 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3645  hypothetical protein  49.69 
 
 		 484 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.348897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  49.11 
 
 		 507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0330  hypothetical protein  48.47 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  48.61 
 
 		 529 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  48.88 
 
 		 505 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0299  hypothetical protein  49.08 
 
 		 484 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.281657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3841  hypothetical protein  49.28 
 
 		 484 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.261021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  49.8 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1396  hypothetical protein  48.88 
 
 		 520 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1456  hypothetical protein  48.21 
 
 		 529 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0629194  hitchhiker  0.0000911668 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  48.02 
 
 		 483 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3959  hypothetical protein  47.4 
 
 		 480 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.901643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  47.26 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  47.26 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  47.26 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  46.68 
 
 		 498 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0971  hypothetical protein  46.03 
 
 		 488 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  47.5 
 
 		 478 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  48.17 
 
 		 478 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0262  hypothetical protein  48.64 
 
 		 484 aa  435  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0540554  normal  0.0168688 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  48.17 
 
 		 478 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  48.03 
 
 		 483 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  47.71 
 
 		 478 aa  435  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  47.5 
 
 		 478 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  47.29 
 
 		 478 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  47.74 
 
 		 478 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  48.17 
 
 		 478 aa  431  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  48.39 
 
 		 478 aa  431  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0308  hypothetical protein  48 
 
 		 483 aa  428  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0254223  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  46.68 
 
 		 496 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  47.06 
 
 		 495 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  46 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2395  hypothetical protein  46.77 
 
 		 496 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  46.48 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0407  hypothetical protein  46.18 
 
 		 493 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  47.18 
 
 		 500 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2027  protein of unknown function UPF0061  46.65 
 
 		 495 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4038  hypothetical protein  45.81 
 
 		 484 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1864  hypothetical protein  46.15 
 
 		 544 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3659  hypothetical protein  46.42 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.269088  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3961  protein of unknown function UPF0061  45.6 
 
 		 484 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4156  hypothetical protein  45.6 
 
 		 484 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  45.83 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4063  hypothetical protein  45.81 
 
 		 484 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  44.51 
 
 		 498 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2935  protein of unknown function UPF0061  47.1 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  45.04 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1800  hypothetical protein  45.02 
 
 		 476 aa  402  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  44.47 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  45.27 
 
 		 510 aa  388  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  42 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  41.14 
 
 		 491 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2514  hypothetical protein  44.22 
 
 		 490 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  42.39 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>