More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5022 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5022  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.670825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4896  ABC transporter related  99.18 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0657003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5072  ABC transporter related  99.18 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  96.31 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  90.16 
 
 		 244 aa  454  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  88.93 
 
 		 244 aa  447  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  88.52 
 
 		 244 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  68.03 
 
 		 243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  67.21 
 
 		 248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  63.52 
 
 		 248 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  65.98 
 
 		 243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  65.57 
 
 		 243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  63.11 
 
 		 248 aa  318  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.52 
 
 		 240 aa  315  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  63.11 
 
 		 239 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  65.78 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.7 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.7 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.7 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.3 
 
 		 240 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  63.52 
 
 		 240 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.7 
 
 		 240 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.3 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.89 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  61.07 
 
 		 247 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  62.45 
 
 		 246 aa  304  7e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  62.3 
 
 		 240 aa  304  7e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  60.66 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  61.33 
 
 		 249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  61.89 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  59.02 
 
 		 243 aa  301  9e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  63.11 
 
 		 244 aa  300  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  61.48 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  61.07 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  61.89 
 
 		 240 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  59.02 
 
 		 243 aa  300  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  59.02 
 
 		 255 aa  298  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  63.11 
 
 		 242 aa  298  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  61.32 
 
 		 249 aa  295  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  59.91 
 
 		 243 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  61.71 
 
 		 242 aa  295  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  61.06 
 
 		 260 aa  295  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  60.66 
 
 		 252 aa  295  6e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  59.35 
 
 		 246 aa  294  8e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  62.78 
 
 		 242 aa  293  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  58.2 
 
 		 247 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07290  amino acid ABC transporter, ATP binding component  60.98 
 
 		 244 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175528  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  58.61 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  58.2 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.2 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  60.62 
 
 		 266 aa  292  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2090  ABC transporter component  59.02 
 
 		 247 aa  292  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.810567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  62.05 
 
 		 246 aa  292  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  61.78 
 
 		 247 aa  291  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  58.2 
 
 		 252 aa  291  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3694  ABC transporter related  59.84 
 
 		 248 aa  291  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.749012  normal  0.245017 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  58.11 
 
 		 246 aa  291  8e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  58.61 
 
 		 243 aa  291  8e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  57.79 
 
 		 242 aa  291  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  58.41 
 
 		 242 aa  291  9e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  56.56 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  59.02 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  60.66 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  57.79 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  61.14 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  60.08 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3166  ABC transporter related  57.38 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.631435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  62.05 
 
 		 246 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  59.47 
 
 		 243 aa  289  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  59.29 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  59.02 
 
 		 240 aa  289  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  56.91 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  59.59 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  59.59 
 
 		 240 aa  288  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  60.25 
 
 		 245 aa  288  5.0000000000000004e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  57.32 
 
 		 244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  58.2 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  56.15 
 
 		 264 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  60.89 
 
 		 250 aa  288  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  57.38 
 
 		 249 aa  288  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  60.25 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  58.44 
 
 		 246 aa  288  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  56.91 
 
 		 240 aa  288  7e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  59.47 
 
 		 244 aa  288  7e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  58.2 
 
 		 253 aa  287  9e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  58.2 
 
 		 243 aa  287  9e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  56.97 
 
 		 240 aa  287  9e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0446  putative polar amino acid transport system ATP-binding protein  56.91 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  61.4 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46950  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.91 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.832772  hitchhiker  0.00625095 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  57.79 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  62.05 
 
 		 257 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  56.97 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  61.61 
 
 		 257 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.79 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  58.02 
 
 		 247 aa  285  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>