198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4983 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  100 
 
 		 619 aa  1246    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  74.1 
 
 		 625 aa  812    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  90 
 
 		 616 aa  1036    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  69.22 
 
 		 624 aa  819    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  80.31 
 
 		 592 aa  837    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  80.94 
 
 		 565 aa  1006    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  67.74 
 
 		 496 aa  706    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  98.71 
 
 		 619 aa  1231    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  68.89 
 
 		 496 aa  708    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  66.32 
 
 		 491 aa  626  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  26.19 
 
 		 454 aa  105  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  25.21 
 
 		 469 aa  94.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  26.88 
 
 		 445 aa  93.6  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  25.58 
 
 		 628 aa  93.6  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  25.39 
 
 		 456 aa  93.6  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  24.95 
 
 		 528 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  26.19 
 
 		 444 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  23.64 
 
 		 469 aa  91.3  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  24.84 
 
 		 431 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  24.17 
 
 		 479 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  24.34 
 
 		 525 aa  87.4  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  27.27 
 
 		 459 aa  87  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  25.94 
 
 		 435 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  24.24 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  24.68 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  23.64 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  24.07 
 
 		 523 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  25.5 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  26.21 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  25.22 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  24.75 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  24.79 
 
 		 491 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  27.27 
 
 		 450 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 		 494 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  27.27 
 
 		 450 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  25.16 
 
 		 578 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  23.89 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  23.17 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  24.35 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  24.72 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  25.45 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  25.16 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  23.38 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  26.72 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  24.89 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  26.64 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  24.52 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  26.47 
 
 		 465 aa  69.7  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  21.31 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  24.32 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  24.12 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  22.92 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  23.92 
 
 		 459 aa  66.6  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  27.85 
 
 		 1199 aa  65.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  27.62 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  24.04 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  25.99 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  27.16 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  26.17 
 
 		 1274 aa  62.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  22.44 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  23.8 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  21.33 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4445  amine oxidase  22.72 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  24.41 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  23.09 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  21.44 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  25.35 
 
 		 528 aa  57.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  29.17 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  22.51 
 
 		 564 aa  57.4  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  20.65 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  24.3 
 
 		 478 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  21.26 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  24.3 
 
 		 478 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  21.26 
 
 		 482 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  21.41 
 
 		 485 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  21.26 
 
 		 487 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  26.46 
 
 		 427 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  21.26 
 
 		 482 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  21.28 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  24.44 
 
 		 462 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  21.91 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  26.17 
 
 		 454 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  23.19 
 
 		 438 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  21.29 
 
 		 418 aa  55.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  21.33 
 
 		 490 aa  55.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 487 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  23.69 
 
 		 463 aa  54.7  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  22.75 
 
 		 478 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  23.96 
 
 		 572 aa  53.9  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  23.16 
 
 		 498 aa  53.9  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  23.01 
 
 		 490 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  22.82 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  23.68 
 
 		 499 aa  53.5  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  22.75 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  22.75 
 
 		 478 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  22.66 
 
 		 498 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  22.66 
 
 		 498 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  22.75 
 
 		 478 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  22.75 
 
 		 478 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  26.73 
 
 		 474 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>