More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4927 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  100 
 
 		 731 aa  1459    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  62.17 
 
 		 725 aa  895    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.71 
 
 		 717 aa  650    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  49.5 
 
 		 739 aa  658    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  70.25 
 
 		 720 aa  1006    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  49.37 
 
 		 721 aa  643    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  47.89 
 
 		 724 aa  647    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  47.89 
 
 		 724 aa  647    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  49.43 
 
 		 741 aa  655    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  60.42 
 
 		 728 aa  855    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  67.71 
 
 		 750 aa  953    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  51.8 
 
 		 739 aa  677    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  60.31 
 
 		 728 aa  851    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  59.8 
 
 		 720 aa  810    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  57.6 
 
 		 705 aa  759    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  59.8 
 
 		 720 aa  810    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  49.86 
 
 		 720 aa  644    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  57.53 
 
 		 726 aa  777    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  59.11 
 
 		 712 aa  816    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  54.65 
 
 		 706 aa  763    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  58.2 
 
 		 731 aa  823    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  45.83 
 
 		 700 aa  648    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  59.75 
 
 		 743 aa  861    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  62.39 
 
 		 753 aa  825    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  49.79 
 
 		 726 aa  630  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  44.52 
 
 		 892 aa  598  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  44.04 
 
 		 865 aa  587  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  48.5 
 
 		 714 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  42.8 
 
 		 699 aa  580  1e-164  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  43 
 
 		 1008 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  43 
 
 		 1008 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  42.8 
 
 		 712 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  42.8 
 
 		 712 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  42.65 
 
 		 712 aa  554  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  41.38 
 
 		 1024 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  43.57 
 
 		 1003 aa  545  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  43.85 
 
 		 719 aa  545  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  42.66 
 
 		 1001 aa  541  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  42.56 
 
 		 714 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  40.57 
 
 		 999 aa  541  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2004  type I secretion system ATPase  45.4 
 
 		 715 aa  538  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1891  toxin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.4 
 
 		 715 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  42.42 
 
 		 714 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 1000 aa  535  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  39.22 
 
 		 1013 aa  524  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  49.41 
 
 		 523 aa  512  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  44.29 
 
 		 971 aa  513  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  40.91 
 
 		 1038 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  41.13 
 
 		 1038 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  44.58 
 
 		 976 aa  504  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  39.94 
 
 		 1019 aa  505  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  40.67 
 
 		 740 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  40.88 
 
 		 908 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  40.17 
 
 		 906 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  40.4 
 
 		 1012 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.11 
 
 		 1006 aa  491  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  40.03 
 
 		 906 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  40.46 
 
 		 908 aa  492  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  37.2 
 
 		 930 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  39.18 
 
 		 1016 aa  487  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  40.59 
 
 		 1013 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  41.43 
 
 		 980 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  45.01 
 
 		 975 aa  485  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  38.75 
 
 		 986 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  40.56 
 
 		 968 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  40.31 
 
 		 1011 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  39.9 
 
 		 740 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  35.71 
 
 		 1040 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.49 
 
 		 1018 aa  445  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  35.42 
 
 		 982 aa  446  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  35.21 
 
 		 1018 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.92 
 
 		 1018 aa  445  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  34.81 
 
 		 1042 aa  429  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  37.28 
 
 		 730 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  38.39 
 
 		 724 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.78 
 
 		 736 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0535  ABC transporter, transmembrane region  34.87 
 
 		 744 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.622763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1051  ABC transporter related  35.12 
 
 		 744 aa  405  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  38.18 
 
 		 724 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1058  RtxB protein  52.63 
 
 		 368 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  31.88 
 
 		 727 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  32.36 
 
 		 734 aa  369  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  31.77 
 
 		 721 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  33.09 
 
 		 704 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  32.08 
 
 		 734 aa  365  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  33.09 
 
 		 737 aa  363  6e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  31.73 
 
 		 721 aa  362  1e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  33.01 
 
 		 770 aa  361  3e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  36.33 
 
 		 578 aa  361  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.33 
 
 		 578 aa  361  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.14 
 
 		 738 aa  359  8e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  32.56 
 
 		 704 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  33.14 
 
 		 718 aa  357  2.9999999999999997e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  32.66 
 
 		 718 aa  356  6.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.92 
 
 		 759 aa  355  1e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  32.21 
 
 		 739 aa  355  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  30.22 
 
 		 717 aa  353  7e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  30.82 
 
 		 738 aa  352  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3567  ABC transporter related  32.38 
 
 		 767 aa  352  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  31.17 
 
 		 727 aa  350  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>