More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4804 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  100 
 
 		 333 aa  684    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  97.9 
 
 		 333 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  91.84 
 
 		 332 aa  636    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  99.1 
 
 		 333 aa  679    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  72.22 
 
 		 342 aa  494  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  72.14 
 
 		 342 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  74.55 
 
 		 335 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  67.69 
 
 		 341 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  67.59 
 
 		 342 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  65.17 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  65.71 
 
 		 325 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  43.9 
 
 		 297 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  42.2 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  42.07 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  39.45 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  36.17 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  37.08 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  38.06 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  38.65 
 
 		 261 aa  180  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  38.65 
 
 		 265 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  40.23 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  41.09 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  36.91 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  39.84 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  42.69 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  38.28 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  60.14 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  38.55 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  35.52 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  39.53 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  46.53 
 
 		 265 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  49.18 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  57.72 
 
 		 260 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  46.45 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  46.45 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  46.45 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  38.82 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  45.9 
 
 		 277 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  45.99 
 
 		 474 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  48.63 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  46.52 
 
 		 468 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 455 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  51.7 
 
 		 423 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  53.9 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  57.04 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  53.9 
 
 		 280 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  53.9 
 
 		 280 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 283 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  34.42 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  36.93 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  37.45 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  52.48 
 
 		 263 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 417 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  33.64 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  37.45 
 
 		 284 aa  152  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  37.7 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  58.26 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  43.55 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  45.7 
 
 		 293 aa  149  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  35.66 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  52.59 
 
 		 394 aa  149  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  39.61 
 
 		 322 aa  149  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  38.75 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  44 
 
 		 424 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  45.36 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  61.82 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  43.01 
 
 		 409 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  43.59 
 
 		 382 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  58.97 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  41.53 
 
 		 442 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  38.49 
 
 		 286 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  39.53 
 
 		 318 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  54.48 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  55.47 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  51.77 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  36.08 
 
 		 259 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  58.12 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  53.12 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  54.2 
 
 		 471 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  44.21 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  42.05 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  47.5 
 
 		 314 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  60.36 
 
 		 421 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  60.36 
 
 		 419 aa  139  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  38.83 
 
 		 230 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  58.04 
 
 		 238 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  39.81 
 
 		 211 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  52.24 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  57.02 
 
 		 408 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  38.35 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  50 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  38.35 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  38.35 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  49.62 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  43.55 
 
 		 194 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>