230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4791 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1133  ISPpu9, transposase  100 
 
 
442 aa  914    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1260  ISPpu9, transposase  100 
 
 
442 aa  914    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.469395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2570  ISPpu9, transposase  99.77 
 
 
442 aa  912    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110868  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3381  ISPpu9, transposase  99.77 
 
 
442 aa  912    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3586  ISPpu9, transposase  99.77 
 
 
442 aa  912    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4603  ISPpu9, transposase  100 
 
 
442 aa  914    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.79364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4791  ISPpu9, transposase  100 
 
 
442 aa  914    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.8 
 
 
442 aa  428  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4136  transposase  45.37 
 
 
446 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0286  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.94 
 
 
441 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150235  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5544  transposase IS116/IS110/IS902  46.72 
 
 
440 aa  359  6e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.362719 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0024  transposase  41.51 
 
 
454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3738  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.61 
 
 
453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0095  transposase  39.81 
 
 
333 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.856813 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2322  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.17 
 
 
406 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2321  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.17 
 
 
406 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.17 
 
 
406 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1903  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.94 
 
 
406 aa  229  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31 
 
 
406 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.7 
 
 
402 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1822  ISPpu9, transposase  30.72 
 
 
451 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1941  ISPpu9, transposase  30.72 
 
 
451 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.93243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5586  ISPpu9, transposase  30.72 
 
 
451 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5999  ISPpu9, transposase  30.72 
 
 
451 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0408226  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3247  ISPpu9, transposase  30.72 
 
 
451 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155481  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3062  ISPpu9, transposase  30.72 
 
 
451 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.231592  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6342  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.87 
 
 
408 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6341  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.87 
 
 
408 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0725  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.87 
 
 
411 aa  193  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.97 
 
 
408 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.6 
 
 
540 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.6 
 
 
540 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.6 
 
 
542 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.6 
 
 
540 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1024  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.09 
 
 
412 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.09 
 
 
412 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.76 
 
 
444 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2366  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.09 
 
 
412 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.69 
 
 
414 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000113167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0589  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.69 
 
 
414 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.69 
 
 
414 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3853  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.69 
 
 
414 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3436  transposase IS116/IS110/IS902  31.62 
 
 
412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3437  transposase IS116/IS110/IS902  31.37 
 
 
412 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222755  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4122  transposase IS116/IS110/IS902  31.37 
 
 
412 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0407  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.17 
 
 
420 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.17 
 
 
420 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.654295  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3921  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.17 
 
 
420 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.174408  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4655  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.17 
 
 
420 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119916  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.17 
 
 
420 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2124  transposase IS116/IS110/IS902  31.82 
 
 
412 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29674  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1960  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.47 
 
 
411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.261169  normal  0.0163724 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0130  transposase IS116/IS110/IS902  32.43 
 
 
454 aa  166  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1178  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.07 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684459  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3328  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.07 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.07 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166757  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.07 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000420337  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3050  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.07 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.07 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198877 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3130  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.45 
 
 
378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2090  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.2 
 
 
378 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000104804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3292  transposase  47.44 
 
 
330 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000349541 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.01 
 
 
435 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1959  transposase IS116/IS110/IS902  27.65 
 
 
420 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.945198  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.16 
 
 
466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0682  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.16 
 
 
466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.16 
 
 
466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.425839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1282  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.16 
 
 
466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124375  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4398  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.16 
 
 
466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2973  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.16 
 
 
466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0717724  normal  0.0172565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.16 
 
 
466 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.198929  normal  0.0124292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2232  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.16 
 
 
466 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000585875  normal  0.443218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0087  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.16 
 
 
466 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1110  ISAfe3, transposase  30.05 
 
 
408 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0550  ISAfe3, transposase  30.05 
 
 
408 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1265  ISAfe3, transposase  30.05 
 
 
408 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1142  ISAfe3, transposase  30.05 
 
 
408 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2432  ISAfe3, transposase  30.05 
 
 
408 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3263  ISAfe3, transposase  30.05 
 
 
408 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2709  ISAfe3, transposase  30.05 
 
 
408 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2972  ISAfe3, transposase  30.05 
 
 
408 aa  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5208  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
423 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3494  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.17 
 
 
442 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.207887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
423 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
423 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127954  hitchhiker  0.00882366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0957  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
423 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1319  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
423 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622627  normal  0.467675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1287  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.71 
 
 
465 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324635  normal  0.577676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2958  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.07 
 
 
483 aa  150  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1223  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  28.87 
 
 
310 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3061  hypothetical protein  29.38 
 
 
329 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0326  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.32 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1225  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.32 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.32 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.235324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.32 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402524  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.32 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000616647 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3370  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.32 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3374  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.32 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.495996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3377  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.32 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3378  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.32 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.195678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>