More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4774 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 290 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  98.28 
 
 		 290 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  95.17 
 
 		 290 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  89.97 
 
 		 289 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  70.49 
 
 		 297 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  69.79 
 
 		 297 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  69.79 
 
 		 298 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  71.53 
 
 		 298 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  70.42 
 
 		 292 aa  388  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  70.49 
 
 		 298 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  62.5 
 
 		 293 aa  335  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  46.48 
 
 		 318 aa  275  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  46.85 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  48.68 
 
 		 300 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  48.68 
 
 		 300 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  48.68 
 
 		 300 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  48.68 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  48.3 
 
 		 300 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  47.69 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  47.69 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  47.69 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  47.69 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  47.69 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  47.69 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  47.69 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  47.69 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  47.69 
 
 		 300 aa  265  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  48.24 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  48.24 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  45.77 
 
 		 302 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  47.89 
 
 		 300 aa  261  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  46.02 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  46.02 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  46.13 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  46.02 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  49.81 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  46.37 
 
 		 290 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  50.54 
 
 		 289 aa  258  7e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  46.29 
 
 		 302 aa  258  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  45.94 
 
 		 302 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  44.98 
 
 		 289 aa  255  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  49.04 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  46.35 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  48.66 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  47.02 
 
 		 317 aa  249  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  44.98 
 
 		 293 aa  249  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  46.13 
 
 		 300 aa  249  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  46.18 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  45.33 
 
 		 289 aa  245  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  45.67 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  46.13 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  45.33 
 
 		 297 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  44.64 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  44.64 
 
 		 296 aa  237  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  43.94 
 
 		 289 aa  235  7e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  44.98 
 
 		 289 aa  234  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  45.3 
 
 		 325 aa  234  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  43.9 
 
 		 312 aa  231  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  44.21 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  46.26 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  42.45 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  42.21 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  42.75 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  40.48 
 
 		 325 aa  192  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  39.15 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 296 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  34.52 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  31.21 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  35.21 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  30.5 
 
 		 295 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  30.5 
 
 		 295 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  35.16 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  32.97 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  32.75 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  32.97 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  34.18 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  33.98 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  31.42 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  35.37 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  32.82 
 
 		 305 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  32.13 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 315 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  30.71 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  31.62 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  28.3 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  33.21 
 
 		 291 aa  132  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  30.71 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  29.6 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  31.87 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  35.06 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  34.35 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 460 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  34.38 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>