153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4501 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4501  intracellular septation protein A  100 
 
 
197 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211364  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1411  intracellular septation protein A  100 
 
 
197 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0302697  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3790  intracellular septation protein A  97.97 
 
 
210 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000185516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4007  intracellular septation protein A  98.48 
 
 
197 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1486  intracellular septation protein A  85.35 
 
 
198 aa  345  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00672895  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1809  intracellular septation protein A  79.8 
 
 
198 aa  331  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3587  intracellular septation protein A  79.29 
 
 
198 aa  328  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92433  normal  0.454348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15630  intracellular septation protein A  76.14 
 
 
199 aa  317  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00979591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1925  intracellular septation protein A  68.53 
 
 
195 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22800  intracellular septation protein A  68.53 
 
 
195 aa  287  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0697517 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1458  intracellular septation protein A  41.97 
 
 
191 aa  167  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1232  intracellular septation protein A  42.16 
 
 
214 aa  166  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000058039  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1646  intracellular septation protein A  47.09 
 
 
177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117216  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1394  intracellular septation protein A  43.75 
 
 
179 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249115  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2053  intracellular septation protein A  43.81 
 
 
180 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.32056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3451  intracellular septation protein A  43.01 
 
 
197 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2326  intracellular septation protein A  43.81 
 
 
180 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.440646  normal  0.885808 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1944  intracellular septation protein A  43.81 
 
 
180 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2018  Intracellular septation protein A  44.23 
 
 
212 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0839964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1878  intracellular septation protein A  43.01 
 
 
179 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132435 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3397  intracellular septation protein A  42.86 
 
 
178 aa  158  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000148944  normal  0.569394 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01228  intracellular septation protein A  43.01 
 
 
179 aa  157  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2394  intracellular septation protein A  43.01 
 
 
179 aa  157  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2373  intracellular septation protein A  43.01 
 
 
179 aa  157  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107095  hitchhiker  0.00000140578 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1423  intracellular septation protein A  43.01 
 
 
179 aa  157  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0811962  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1741  intracellular septation protein A  43.01 
 
 
179 aa  157  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000411048  hitchhiker  0.00414437 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01238  hypothetical protein  43.01 
 
 
179 aa  157  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1363  intracellular septation protein A  43.01 
 
 
179 aa  157  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000298699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1412  intracellular septation protein A  43.01 
 
 
179 aa  157  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393823  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1746  intracellular septation protein A  38.38 
 
 
186 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468315  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0706  intracellular septation protein A  43.08 
 
 
189 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2285  intracellular septation protein A  42.11 
 
 
179 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62002  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1593  intracellular septation protein A  43.52 
 
 
179 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.876339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1925  intracellular septation protein A  43.52 
 
 
179 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043562 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1862  intracellular septation protein A  43.52 
 
 
179 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1411  intracellular septation protein A  43.52 
 
 
179 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.70012  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1868  intracellular septation protein A  43.52 
 
 
179 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.833804  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2677  intracellular septation protein A  42.11 
 
 
179 aa  154  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123035  hitchhiker  0.000370071 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02768  intracellular septation protein A  40.91 
 
 
190 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1866  intracellular septation protein A  42.19 
 
 
179 aa  151  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2183  intracellular septation protein A  41.62 
 
 
186 aa  151  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0652722  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1499  intracellular septation protein A  39.69 
 
 
190 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1997  intracellular septation protein A  40.4 
 
 
188 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1458  intracellular septation protein A  39.69 
 
 
190 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0637661  hitchhiker  0.00000681861 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2297  intracellular septation protein A  42.63 
 
 
188 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1942  intracellular septation protein A  43.43 
 
 
186 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1766  intracellular septation protein A  40.49 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0828979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2261  intracellular septation protein A  40.39 
 
 
202 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054881  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1147  intracellular septation protein A  39.49 
 
 
181 aa  144  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0975  intracellular septation protein A  37.95 
 
 
181 aa  144  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.240197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1039  intracellular septation protein A  38.46 
 
 
181 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3300  intracellular septation protein A  37.11 
 
 
199 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.646604  normal  0.427683 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1304  intracellular septation protein A  40 
 
 
181 aa  141  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0013936  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1529  intracellular septation protein A  40.19 
 
 
210 aa  141  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0663803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2385  intracellular septation protein A  42.08 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.746787  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003075  intracellular septation protein  35.71 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1933  intracellular septation protein A  37.37 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212071  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6169  intracellular septation protein A  37.37 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1910  intracellular septation protein A  37.37 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1255  intracellular septation protein A  41.54 
 
 
181 aa  138  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2278  intracellular septation protein A  37.89 
 
 
176 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1256  intracellular septation protein A  41.54 
 
 
181 aa  138  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5211  intracellular septation protein A  37.37 
 
 
176 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.18607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1922  intracellular septation protein A  37.37 
 
 
176 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0586627  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1898  intracellular septation protein A  36.84 
 
 
176 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1828  intracellular septation protein A  36.84 
 
 
176 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332077  normal  0.800874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2903  intracellular septation protein A  37.81 
 
 
202 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130707  normal  0.228899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2949  intracellular septation protein A  39 
 
 
189 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1054  intracellular septation protein A  38.07 
 
 
189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2137  intracellular septation protein A  38.14 
 
 
181 aa  131  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1025  intracellular septation protein A  37.89 
 
 
176 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2317  intracellular septation protein A  35.05 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1422  intracellular septation protein A  37.37 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.329571  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0667  intracellular septation protein A  39.5 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1267  intracellular septation protein A  40.1 
 
 
179 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0529442  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0973  intracellular septation protein A  38.07 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0816  intracellular septation protein A  39.5 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1640  intracellular septation protein A  37.89 
 
 
181 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1675  intracellular septation protein A  39.9 
 
 
186 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2937  intracellular septation protein A  39.69 
 
 
179 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553384  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1670  intracellular septation protein A  36.84 
 
 
183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000643505  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2029  intracellular septation protein A  39.9 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2925  intracellular septation protein A  36.55 
 
 
182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00510175  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1467  intracellular septation protein A  36.6 
 
 
181 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0118188  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2735  intracellular septation protein A  36.84 
 
 
203 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000556336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1651  intracellular septation protein A  37.37 
 
 
181 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000729517  hitchhiker  0.0000000000499095 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2814  intracellular septation protein A  36.84 
 
 
203 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000562978  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1840  intracellular septation protein A  35.61 
 
 
212 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3035  intracellular septation protein A  38.86 
 
 
181 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2713  intracellular septation protein A  36.84 
 
 
203 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.115352  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1364  intracellular septation protein A  37.37 
 
 
186 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1449  intracellular septation protein A  38.86 
 
 
181 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0709413  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1505  intracellular septation protein A  38.86 
 
 
181 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158049  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1515  intracellular septation protein A  38.86 
 
 
181 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000828296  normal  0.796513 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2260  intracellular septation protein A  39.47 
 
 
181 aa  121  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000102415  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1834  intracellular septation protein A  33.17 
 
 
208 aa  120  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2416  intracellular septation protein A  36.84 
 
 
181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2111  intracellular septation protein A  38.14 
 
 
181 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00323597  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2397  intracellular septation protein A  35.57 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0809918  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1878  intracellular septation protein A  37.89 
 
 
179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>