More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4388 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 440 aa  879    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  82.95 
 
 		 440 aa  741    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  58.33 
 
 		 451 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  57.14 
 
 		 442 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  57.53 
 
 		 441 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  55.03 
 
 		 443 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  51.93 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  47.73 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  47.52 
 
 		 462 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  42.18 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  42.18 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  41.7 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  41.27 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  42.14 
 
 		 413 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  41.72 
 
 		 414 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  39.05 
 
 		 401 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  42.6 
 
 		 413 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  55 
 
 		 584 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  42.14 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  41.69 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  41.69 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  40.68 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  40.68 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  40.68 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  40.68 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  40.68 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  40.36 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  40.68 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  40.68 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  41.5 
 
 		 414 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  41.5 
 
 		 414 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  41.46 
 
 		 413 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  41.5 
 
 		 414 aa  292  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  42.02 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  40.55 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  40.14 
 
 		 399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  41.91 
 
 		 414 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  37.92 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  41.12 
 
 		 408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  39.82 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  40.05 
 
 		 405 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  40.31 
 
 		 418 aa  283  5.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  38.78 
 
 		 442 aa  282  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  39.1 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  39.1 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.5 
 
 		 395 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  41.11 
 
 		 425 aa  275  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  39.55 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  38.95 
 
 		 406 aa  269  7e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.03 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  38.2 
 
 		 398 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  38.48 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  39.48 
 
 		 453 aa  265  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  38.74 
 
 		 437 aa  264  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  38.92 
 
 		 453 aa  263  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  38.74 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  39.66 
 
 		 453 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  40.05 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  39.15 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  38.03 
 
 		 402 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  38.5 
 
 		 410 aa  256  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  38.04 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  38.84 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.19 
 
 		 400 aa  254  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  39.69 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  38.7 
 
 		 453 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  38.7 
 
 		 453 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  38.7 
 
 		 453 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  37.53 
 
 		 404 aa  252  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  38.15 
 
 		 402 aa  252  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  39.09 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  38.78 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  38.55 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  36.73 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  38.84 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  38.15 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  38.15 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  38.69 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  39.29 
 
 		 425 aa  249  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  38.6 
 
 		 402 aa  249  8e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.26 
 
 		 426 aa  249  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  39.24 
 
 		 401 aa  249  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  38.56 
 
 		 455 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  37.25 
 
 		 453 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.31 
 
 		 423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  37.98 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  37.98 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  37.18 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  38.39 
 
 		 459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  37.47 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  37.13 
 
 		 395 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  37.7 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  35.76 
 
 		 383 aa  242  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  39.1 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  39.1 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  37.92 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  37.92 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  37.92 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  36.65 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  36.95 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>