252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4368 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  100 
 
 		 339 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  99.12 
 
 		 339 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  92.92 
 
 		 339 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  100 
 
 		 339 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  96.76 
 
 		 339 aa  662    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  89.32 
 
 		 338 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  89.79 
 
 		 333 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  86.43 
 
 		 338 aa  597  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  85.84 
 
 		 338 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  85.84 
 
 		 338 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  71.43 
 
 		 347 aa  495  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  69.18 
 
 		 337 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  69.09 
 
 		 346 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  63.75 
 
 		 338 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  58.73 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  58.73 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  56.97 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  55.9 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  54.38 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  56.97 
 
 		 351 aa  388  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2307  flagellar motor switch protein G  56.8 
 
 		 350 aa  388  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  57.14 
 
 		 345 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  55.42 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  55.62 
 
 		 334 aa  384  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  55.08 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1503  flagellar motor switch protein G  56.39 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  56.53 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002816  flagellar motor switch protein FliG  58.15 
 
 		 351 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03161  flagellar motor switch protein G  58.46 
 
 		 351 aa  381  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  55.62 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  56.23 
 
 		 348 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  56.23 
 
 		 348 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  56.53 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1362  flagellar motor switch protein G  55.73 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  55.93 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  55.93 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  56.75 
 
 		 351 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  55.93 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  55.93 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2575  flagellar motor switch protein G  54.71 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1716  flagellar motor switch protein G  57.23 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1619  flagellar motor switch protein G  55.62 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1879  flagellar motor switch protein FliG  56.5 
 
 		 333 aa  363  3e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246079  normal  0.586274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1977  flagellar motor switch protein FliG  49.1 
 
 		 331 aa  358  9e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  51.1 
 
 		 329 aa  358  9e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  54.24 
 
 		 346 aa  352  4e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0772  flagellar motor switch protein FliG  50 
 
 		 334 aa  351  8e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  49.69 
 
 		 329 aa  348  7e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  49.69 
 
 		 329 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2932  flagellar motor switch protein G  49.07 
 
 		 331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3062  flagellar motor switch protein G  51.1 
 
 		 331 aa  342  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0199  flagellar motor switch protein G  50.78 
 
 		 331 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0566  flagellar motor switch protein  49.39 
 
 		 331 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2451  flagellar motor switch protein G  50.47 
 
 		 331 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00544517  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3065  flagellar motor switch protein G  50.47 
 
 		 331 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00336873  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3084  flagellar motor switch protein G  50.47 
 
 		 331 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3771  flagellar motor switch protein G  49.84 
 
 		 331 aa  338  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0165  flagellar motor switch protein G  49.84 
 
 		 331 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3110  flagellar motor switch protein G  49.84 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2976  flagellar motor switch protein G  49.84 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3280  flagellar motor switch protein G  49.53 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0416  flagellar motor switch protein G  49.53 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2945  flagellar motor switch protein G  49.53 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0221  flagellar motor switch protein G  49.53 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0619042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0233  flagellar motor switch protein G  49.53 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631477  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1601  flagellar motor switch protein FliG  48.49 
 
 		 333 aa  335  9e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523158  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6414  flagellar motor switch protein G  49.84 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2143  flagellar motor switch protein G  49.22 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3401  flagellar motor switch protein G  49.22 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2900  flagellar motor switch protein FliG  50 
 
 		 333 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  47.24 
 
 		 333 aa  332  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0391  flagellar motor switch protein G  49.84 
 
 		 330 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.977742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1346  flagellar motor switch protein FliG  48.62 
 
 		 332 aa  328  7e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4730  flagellar motor switch protein G  47.65 
 
 		 330 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.231859  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3653  flagellar motor switch protein G  47.65 
 
 		 330 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.552774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0551  flagellar motor switch protein FliG  46.75 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3806  flagellar motor switch protein FliG  46.73 
 
 		 331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.055767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  46.42 
 
 		 331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  46.42 
 
 		 331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1114  flagellar motor switch protein FliG  46.75 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0639  flagellar motor switch protein FliG  47.22 
 
 		 331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1956  flagellar motor switch protein FliG  46.46 
 
 		 331 aa  295  9e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5262  flagellar motor switch protein G  45 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0973096  normal  0.0777701 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1575  flagellar motor switch protein G  44.44 
 
 		 330 aa  291  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2291  flagellar motor switch protein G  45.2 
 
 		 330 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.60642  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2013  flagellar motor switch protein G  45.2 
 
 		 330 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2392  flagellar motor switch protein G  45.2 
 
 		 330 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178254  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1890  flagellar motor switch protein G  44.58 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5098  flagellar motor switch protein G  45 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699284  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0054  flagellar motor switch protein FliG  44.07 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2948  flagellar motor switch protein G  44.27 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1689  flagellar motor switch protein FliG  44.07 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00159309  hitchhiker  0.00060474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2576  flagellar motor switch protein G  44.89 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0189022  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2530  flagellar motor switch protein G  44 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1149  flagellar motor switch protein G  44 
 
 		 331 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2133  flagellar motor switch protein G  44 
 
 		 331 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184117 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1272  flagellar motor switch protein G  44 
 
 		 331 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.674292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2186  flagellar motor switch protein G  44 
 
 		 331 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.296587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2128  flagellar motor switch protein G  44 
 
 		 331 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1541  flagellar motor switch protein G  43.96 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>