More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4206 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  98.87 
 
 		 441 aa  859    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  100 
 
 		 441 aa  864    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  78.74 
 
 		 438 aa  636    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  80.5 
 
 		 450 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  95.24 
 
 		 441 aa  764    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  97.73 
 
 		 441 aa  763    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  78.97 
 
 		 438 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  52.01 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  51.17 
 
 		 429 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  52.01 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  51.77 
 
 		 429 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  51.43 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  54.39 
 
 		 436 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  52.64 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  51.43 
 
 		 438 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  51.43 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  53.18 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  51.3 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  49.52 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  51.31 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  51.54 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  49.05 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  52.11 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  52.11 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  52.11 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  50.94 
 
 		 436 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  47.25 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 487 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  49.76 
 
 		 466 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  50.24 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  50.97 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  51.21 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  47.25 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  47.78 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  46.05 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  48.72 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  49.16 
 
 		 442 aa  375  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  48.48 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  49.04 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  49.04 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  49.88 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  49.88 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  49.88 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  49.04 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  48.56 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  49.88 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  49.88 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  48.56 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  49.64 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  48.97 
 
 		 441 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  48.06 
 
 		 447 aa  360  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  47.68 
 
 		 442 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  47.7 
 
 		 442 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  45.76 
 
 		 437 aa  346  4e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  48.83 
 
 		 387 aa  318  7.999999999999999e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  41.3 
 
 		 436 aa  318  9e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  40.45 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  38.42 
 
 		 436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  38.16 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  38.16 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  46.46 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  39.95 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  39.53 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  39.4 
 
 		 407 aa  257  4e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  35.01 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  36.36 
 
 		 443 aa  252  1e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  34.12 
 
 		 415 aa  247  3e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  36.17 
 
 		 438 aa  246  6.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 433 aa  214  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 444 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 435 aa  205  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 443 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 461 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  35.12 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  33.57 
 
 		 496 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  34.68 
 
 		 444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  33.57 
 
 		 496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  32.86 
 
 		 493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 495 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  33.68 
 
 		 527 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 438 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1103  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 452 aa  197  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  33.89 
 
 		 452 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 435 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 440 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0760  proline/betaine transporter  35.25 
 
 		 495 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 444 aa  196  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0553  proline/betaine transporter  35.25 
 
 		 495 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1270  proline/betaine transporter  35.25 
 
 		 495 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0643397  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1462  putative proline/betaine transporter  35.25 
 
 		 495 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1492  putative proline/betaine transporter  35.25 
 
 		 534 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0600  proline/betaine transporter  35.25 
 
 		 534 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175183  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  33.85 
 
 		 531 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>