More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4104 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4104  glutathione S-transferase family protein  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1760  glutathione S-transferase domain-containing protein  99.57 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3677  glutathione S-transferase domain-containing protein  94.81 
 
 		 231 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145175  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3378  glutathione S-transferase domain-containing protein  91.77 
 
 		 231 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1531  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.79 
 
 		 233 aa  377  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195621  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  72.84 
 
 		 362 aa  362  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1375  glutathione S-transferase-like  76.19 
 
 		 234 aa  362  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1203  glutathione S-transferase-like  75 
 
 		 234 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1682  glutathione S-transferase domain-containing protein  75 
 
 		 234 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1600  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.14 
 
 		 234 aa  360  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  0.388565 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1655  glutathione S-transferase domain-containing protein  75 
 
 		 234 aa  360  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440036  normal  0.557594 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4836  glutathione S-transferase-like protein  74.57 
 
 		 234 aa  360  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33242  hitchhiker  0.00725172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3732  Glutathione S-transferase domain protein  74.46 
 
 		 234 aa  360  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1563  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.57 
 
 		 234 aa  360  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.221401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1581  glutathione S-transferase domain-containing protein  73.71 
 
 		 234 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0242583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3350  putative glutathione S-transferase  73.16 
 
 		 235 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1147  Glutathione S-transferase domain  73.59 
 
 		 235 aa  355  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4017  glutathione S-transferase-like  75.32 
 
 		 234 aa  354  5e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.34 
 
 		 232 aa  353  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0798  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.11 
 
 		 237 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.808485  normal  0.965794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3984  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.35 
 
 		 255 aa  352  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1547  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.73 
 
 		 234 aa  350  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2123  putative glutathione S-transferase  71.12 
 
 		 234 aa  348  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1980  putative glutathione S-transferase  71.12 
 
 		 234 aa  348  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1961  putative glutathione S-transferase  71.12 
 
 		 234 aa  348  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4929  glutathione S-transferase  70.56 
 
 		 235 aa  347  7e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.574827  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0251  putative glutathione S-transferase  70.69 
 
 		 234 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1591  putative glutathione S-transferase  70.69 
 
 		 234 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0909  putative glutathione S-transferase  70.69 
 
 		 234 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0259435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1151  glutathione S-transferase, putative  70.26 
 
 		 234 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.86 
 
 		 240 aa  342  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3752  glutathione S-transferase-like protein  71.86 
 
 		 235 aa  341  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  70.56 
 
 		 234 aa  336  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3493  glutathione S-transferase  69.7 
 
 		 244 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0558771  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0090  glutathione S-transferase  68.83 
 
 		 234 aa  330  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162685  normal  0.0936415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3750  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.26 
 
 		 234 aa  329  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.24 
 
 		 235 aa  323  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1580  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.53 
 
 		 234 aa  320  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  0.296422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0234  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.8 
 
 		 234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0097  glutathione S-transferase-like protein  62.34 
 
 		 234 aa  307  6.999999999999999e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.92 
 
 		 231 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0551186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0127  glutathione S-transferase family protein  61.04 
 
 		 234 aa  304  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8437  Glutathione S-transferase domain protein  64.13 
 
 		 231 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2264  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.13 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0512  glutathione S-transferase-like protein  63.68 
 
 		 229 aa  298  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.624431  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5174  glutathione S-transferase-like  63.23 
 
 		 232 aa  297  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3326  Glutathione S-transferase domain protein  75.94 
 
 		 205 aa  294  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.05 
 
 		 235 aa  286  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0240  glutathione S-transferase domain protein  61.47 
 
 		 232 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0513  Glutathione S-transferase domain protein  59.48 
 
 		 236 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0456  glutathione S-transferase-like  56.52 
 
 		 233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  57.76 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0468  Glutathione S-transferase domain  57.76 
 
 		 236 aa  269  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  51.9 
 
 		 230 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.43 
 
 		 230 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  51.9 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.9 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.9 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.95 
 
 		 230 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.95 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  51.64 
 
 		 233 aa  208  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  48.57 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  48.62 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  47.14 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.3 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  48.57 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.33 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.1 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  48.57 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.11 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  46.05 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.05 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  45.58 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  47.14 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  46.19 
 
 		 211 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.19 
 
 		 211 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  48.8 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  46.89 
 
 		 211 aa  191  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.95 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  46.67 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  44.86 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.39 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  48.57 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.57 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.19 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0891  glutathione S-transferase-like protein  48.54 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  48.34 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  48.34 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  47.89 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  43.54 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  47.87 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  46.67 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  45.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  44.6 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7359  putative glutathione S-transferase  46.19 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  44.34 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  46.01 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0831  Glutathione S-transferase domain protein  43.6 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0286662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.19 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  44.86 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>