33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4076 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4076  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  279  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000287373  unclonable  0.000000759929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2622  hypothetical protein  87.5 
 
 		 136 aa  239  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2125  GPW/gp25 family protein  86.76 
 
 		 136 aa  235  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.718172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3226  type VI secretion system lysozyme-related protein  83.09 
 
 		 136 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2527  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.61 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3731  hypothetical protein  36.04 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1198  GPW/gp25 family protein  31.06 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.308622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0029  hypothetical protein  31.54 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.475972  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2805  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.24 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  29.01 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  26.21 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.21 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  26.21 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.72 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  25.95 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  26.55 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  29.01 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  29.01 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  29.01 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  29.81 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  29.81 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1228  hypothetical protein  28.24 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225537 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  29.81 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1109  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.24 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  28.24 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  26.47 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  26.87 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  27.48 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  22.88 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  41.82 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  25.96 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  26.32 
 
 		 154 aa  40.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>