232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3953 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 		 484 aa  951    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  68.94 
 
 		 484 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  69.57 
 
 		 484 aa  673    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  69.98 
 
 		 484 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  69.15 
 
 		 484 aa  659    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  69.57 
 
 		 484 aa  666    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  68.94 
 
 		 484 aa  655    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  69.77 
 
 		 484 aa  661    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  74.38 
 
 		 484 aa  698    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  69.57 
 
 		 484 aa  660    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  74.79 
 
 		 484 aa  695    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  69.15 
 
 		 484 aa  663    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  91.12 
 
 		 484 aa  861    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  95.87 
 
 		 484 aa  886    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  68.94 
 
 		 483 aa  632  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  69.77 
 
 		 483 aa  634  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  54.07 
 
 		 481 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  52.4 
 
 		 481 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  52.82 
 
 		 481 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  53.86 
 
 		 480 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  52.19 
 
 		 480 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  52.82 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  52.82 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  53.03 
 
 		 480 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  52.82 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  52.82 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  53.03 
 
 		 480 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  53.44 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  52.19 
 
 		 480 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  52.82 
 
 		 480 aa  451  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  52.82 
 
 		 480 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  51.98 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  52.08 
 
 		 480 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  51.88 
 
 		 480 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  49.58 
 
 		 481 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  54.92 
 
 		 493 aa  421  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  48.33 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  49.16 
 
 		 490 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  48.51 
 
 		 472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  41.7 
 
 		 482 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  43.06 
 
 		 482 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  47.48 
 
 		 498 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  45.68 
 
 		 485 aa  360  4e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  41.49 
 
 		 482 aa  358  8e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  43.83 
 
 		 498 aa  350  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  40.86 
 
 		 466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  41.33 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  39.96 
 
 		 500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  39.74 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  41.08 
 
 		 510 aa  305  9.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  39.13 
 
 		 484 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  39.66 
 
 		 488 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  35.98 
 
 		 482 aa  289  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  38.19 
 
 		 483 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  35.91 
 
 		 482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  35.91 
 
 		 482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  37.76 
 
 		 485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  37.63 
 
 		 491 aa  286  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  36.48 
 
 		 484 aa  286  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.16 
 
 		 483 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  36.38 
 
 		 483 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  37.68 
 
 		 498 aa  281  3e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  37.87 
 
 		 494 aa  279  8e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  35.31 
 
 		 481 aa  279  8e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  39.75 
 
 		 484 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  35.23 
 
 		 466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  35.22 
 
 		 479 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  35.02 
 
 		 478 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  36.02 
 
 		 482 aa  272  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  35.2 
 
 		 485 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  36.49 
 
 		 483 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  37.92 
 
 		 483 aa  270  4e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  38.74 
 
 		 484 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  37.29 
 
 		 483 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  37.09 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  32.8 
 
 		 485 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  35.66 
 
 		 485 aa  264  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  36.89 
 
 		 485 aa  263  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  37.03 
 
 		 481 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  35.91 
 
 		 481 aa  262  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  33.85 
 
 		 482 aa  262  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  37.68 
 
 		 488 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  36.48 
 
 		 485 aa  260  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0877  cation transporter  34.45 
 
 		 483 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  36.97 
 
 		 486 aa  259  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  36.07 
 
 		 479 aa  259  8e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  38.12 
 
 		 498 aa  258  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  32.78 
 
 		 483 aa  257  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001986  potassium uptake protein TrkH  37.01 
 
 		 485 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  34.53 
 
 		 483 aa  256  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  36.21 
 
 		 486 aa  256  7e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  35.17 
 
 		 485 aa  256  7e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  31.79 
 
 		 485 aa  256  7e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  35.86 
 
 		 485 aa  256  8e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  37.06 
 
 		 491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  36.31 
 
 		 484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  37.09 
 
 		 485 aa  254  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  36.1 
 
 		 484 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  33.47 
 
 		 486 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  36.12 
 
 		 482 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>