47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3697 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  100 
 
 		 694 aa  1430    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  54.36 
 
 		 1045 aa  696    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  53.54 
 
 		 979 aa  612  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1126 aa  194  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  28.08 
 
 		 1124 aa  181  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1118 aa  166  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  26.06 
 
 		 1143 aa  164  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  27.79 
 
 		 1154 aa  162  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  27.1 
 
 		 1153 aa  157  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1137 aa  156  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1125 aa  140  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1120 aa  136  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1128 aa  136  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1120 aa  133  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1123 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1120 aa  132  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1121 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1118 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1120 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1120 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1151 aa  129  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  24.4 
 
 		 1130 aa  129  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  26.18 
 
 		 1140 aa  127  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1122 aa  126  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1126 aa  126  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  24.51 
 
 		 1133 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1114 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1121 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  25 
 
 		 1136 aa  120  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1125 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1121 aa  118  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1144 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1166 aa  117  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  24.39 
 
 		 1124 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1133 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1143 aa  114  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1121 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1121 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1121 aa  109  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1125 aa  107  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1146 aa  88.2  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  22.14 
 
 		 1181 aa  75.9  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  27.88 
 
 		 352 aa  70.1  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  32.67 
 
 		 1107 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  24.88 
 
 		 1207 aa  47  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  27.61 
 
 		 658 aa  44.3  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  29.63 
 
 		 1093 aa  43.9  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>