46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3696 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  826    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  61.44 
 
 		 1045 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  60.05 
 
 		 979 aa  464  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  61.29 
 
 		 462 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  30.38 
 
 		 1124 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1128 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  28.21 
 
 		 1136 aa  96.3  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1137 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1126 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1121 aa  89.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1118 aa  88.2  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1118 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1120 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1120 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1120 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  27.21 
 
 		 1130 aa  86.3  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1125 aa  86.3  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1144 aa  84.7  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1126 aa  83.6  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1122 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  27.5 
 
 		 1143 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1121 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1123 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1143 aa  80.1  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  25 
 
 		 1125 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1120 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1166 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  24 
 
 		 1121 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1121 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  25.19 
 
 		 1153 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1121 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1121 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  24.51 
 
 		 1154 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  26.6 
 
 		 1124 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1133 aa  70.1  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1120 aa  66.6  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  23.62 
 
 		 1140 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1146 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1125 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1114 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1151 aa  57.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  24.17 
 
 		 1133 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1181 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1141 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  22.62 
 
 		 1109 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  27.27 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>