25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3695 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3695  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  781    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000243995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03285  hypothetical protein  50.92 
 
 		 381 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157228  unclonable  1.30992e-21 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0874  hypothetical protein  51.72 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3161  hypothetical protein  27.05 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2293  hypothetical protein  27.34 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.893787  normal  0.236124 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2188  hypothetical protein  25.9 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0515  hypothetical protein  24.31 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22920  hypothetical protein  30.86 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2281  hypothetical protein  25.51 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0891  hypothetical protein  26.02 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0734  hypothetical protein  23.82 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00069101 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0844  hypothetical protein  23.68 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1443  hypothetical protein  29.44 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0740  hypothetical protein  25.06 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0783  hypothetical protein  24.69 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1808  hypothetical protein  24.88 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1134  hypothetical protein  34.55 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1627  hypothetical protein  27.39 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0867  hypothetical protein  21.69 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0014  conserved hypothetical cytosolic protein  25.06 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1439  hypothetical protein  32.12 
 
 		 145 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0052  conserved hypothetical cytosolic protein  26.72 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03540  hypothetical protein  28.51 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14007  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0062  hypothetical protein  28.86 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0225  hypothetical protein  24.68 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>