14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3618 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3618  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  617  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00152122  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2114  hypothetical protein  97.23 
 
 
292 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3617  hypothetical protein  85.57 
 
 
298 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00595661  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3114  hypothetical protein  84.8 
 
 
297 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2298  hypothetical protein  81.82 
 
 
296 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3237  hypothetical protein  82.09 
 
 
296 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141519  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2611  hypothetical protein  72.64 
 
 
319 aa  459  1e-128  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0183477  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3619  hypothetical protein  70.93 
 
 
298 aa  446  1e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00105207  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2075  hypothetical protein  24.19 
 
 
377 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63181  normal  0.802537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2554  hypothetical protein  25.29 
 
 
375 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0471798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  22.99 
 
 
373 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  28.03 
 
 
376 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_003296  RS01955  hypothetical protein  24.05 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.409206  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3389  hypothetical protein  26.38 
 
 
385 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.473518  normal  0.340951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>