34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3389 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3389  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  788    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.473518  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2075  hypothetical protein  80.05 
 
 		 377 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63181  normal  0.802537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2368  hypothetical protein  79.14 
 
 		 373 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.196072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2554  hypothetical protein  77.27 
 
 		 375 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3668  hypothetical protein  73.91 
 
 		 376 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.249577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  29.73 
 
 		 309 aa  132  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2244  hypothetical protein  29.79 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0062  hypothetical protein  24.14 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0060  hypothetical protein  23.47 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3774  hypothetical protein  23.33 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0819622 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1780  hypothetical protein  29.71 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0414443  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7603  hypothetical protein  25.75 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5171  hypothetical protein  21.96 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000028676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  24.91 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0058  hypothetical protein  22.63 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  26.8 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1593  hypothetical protein  32.17 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1618  hypothetical protein  32.17 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1774  hypothetical protein  32.17 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000428291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01526  hypothetical protein  27.53 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.663911  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7606  hypothetical protein  26.41 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02059  hypothetical protein  27.95 
 
 		 220 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3482  hypothetical protein  23.15 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.89107  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7605  hypothetical protein  27.41 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3749  hypothetical protein  25.85 
 
 		 322 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2758  hypothetical protein  26.89 
 
 		 308 aa  49.7  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4614  hypothetical protein  27.08 
 
 		 280 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3864  hypothetical protein  26.57 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7604  hypothetical protein  24.64 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2114  hypothetical protein  26.54 
 
 		 292 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3618  hypothetical protein  26.54 
 
 		 297 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00152122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3619  hypothetical protein  24.79 
 
 		 305 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0881577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2277  hypothetical protein  23.87 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2294  carbamoyl phosphate synthase small subunit  31.11 
 
 		 386 aa  42.7  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>