More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3199 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  53.48 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  51.34 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  46.13 
 
 		 379 aa  325  7e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  44.83 
 
 		 376 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  47.03 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  45.07 
 
 		 372 aa  299  6e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  40.46 
 
 		 376 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  41.55 
 
 		 376 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  38.3 
 
 		 376 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  41.16 
 
 		 376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  37.84 
 
 		 373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  35.57 
 
 		 399 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  36.52 
 
 		 376 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  34.39 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  36.41 
 
 		 377 aa  216  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  34.69 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  29.23 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  29.23 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  32.42 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  34.25 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  29.12 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  28.46 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  29.3 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  28.46 
 
 		 377 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  28.78 
 
 		 374 aa  122  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  30.9 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  31.65 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  32.46 
 
 		 387 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.3 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  28.28 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  31.23 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  32.95 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  29.59 
 
 		 399 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  33.12 
 
 		 393 aa  112  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  31.6 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  32.9 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  30.09 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  28.93 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  30.38 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  31.75 
 
 		 388 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  31.38 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.13 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  29.13 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  32.01 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  33.23 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  30.29 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  29.59 
 
 		 409 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  31.66 
 
 		 422 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.95 
 
 		 404 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 378 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  31.71 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  30.06 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  31.01 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  29.1 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  31.01 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  27.57 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  30.63 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  27.86 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  29.64 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  31.09 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  32.44 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  29.52 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  29.1 
 
 		 419 aa  103  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  29.88 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  28.93 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  30.12 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  31.01 
 
 		 393 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  29.21 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  29.43 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  31.35 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  29.66 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  27.98 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  28.95 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  32 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  29.13 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  30.61 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  28.07 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  28.65 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  27.7 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  29.77 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  27.7 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  27.32 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  25.48 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  31.52 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  28.01 
 
 		 376 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4928  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductase-like protein  44.44 
 
 		 123 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  29.55 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  29.22 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  28.36 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  29.1 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  31.78 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  28.66 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  28.54 
 
 		 400 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  27.91 
 
 		 385 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  27.91 
 
 		 385 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  31.02 
 
 		 388 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  27.91 
 
 		 385 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  30.23 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>