129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3186 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3186  transcriptional activator, TenA family  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2530  TenA family transcription regulator  98.17 
 
 		 221 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2663  TenA family transcription regulator  97.24 
 
 		 219 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387648  normal  0.982111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2677  TenA family transcription regulator  90.41 
 
 		 219 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0858  TENA/THI-4 protein  74.89 
 
 		 220 aa  339  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2025  TenA family transcription regulator  60.75 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0151  transcriptional activator, TenA family  56.28 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2374  transcriptional activator  46.33 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000867  thiaminase II  44.91 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06842  transcriptional regulator  44.91 
 
 		 222 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3122  TenA family transcription regulator  48.37 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0406  transcriptional activator, TenA family  43.98 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.23459 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0490  putative thiaminase (transcriptional activator TenA)  43.26 
 
 		 220 aa  174  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.610131  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0279  TenA family transcription regulator  44.09 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1209  TenA family transcription regulator  42.99 
 
 		 238 aa  171  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0212  transcriptional regulator TenA, putative  42.79 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0203  putative transcriptional regulator TenA  42.79 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0908  transcriptional activator  44.34 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0035  TenA family transcription regulator  43.78 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  44.06 
 
 		 510 aa  160  9e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3656  TenA family transcription regulator  42.2 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.754332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0466  TenA/Thi-4 family protein  34.72 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00130  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  36.23 
 
 		 561 aa  142  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0491  TenA/Thi-4 family protein  34.26 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1497  TenA/Thi-4 family protein  33.49 
 
 		 222 aa  142  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2870  transcriptional activator TenA  30.28 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0284  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator, TenA/Thi-4-like protein  35.02 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0612  TenA family transcription regulator  34.58 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.741623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4549  putative transcriptional activator TenA  32.24 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00503672  normal  0.282706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0795  transcriptional activator TenA, putative  32.24 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0879  putative transcriptional activator TenA  32.24 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00330179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0691  transcriptional activator TenA  32.24 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  32.24 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0725  transcriptional activator TenA  32.24 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00338422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  32.24 
 
 		 231 aa  118  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000639213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0641  TenA family transcription regulator  32.24 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0782  putative transcriptional activator TenA  31.63 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5519  transcriptional activator, TenA family  37.02 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0644  transcriptional activator, TenA family  31.1 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0802  putative transcriptional activator TenA  30.7 
 
 		 231 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15416e-46 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2482  transcriptional activator, TenA family  28.5 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2707  transcriptional activator, TenA family  30.73 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1156  transcriptional activator, TenA family  27.78 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000598897  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0869  transcriptional activator, TenA family  30.41 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04021  TENA/THI-4 protein  30.37 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.484099  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0684  transcriptional activator, TenA family  32.09 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2784  TenA family transcription regulator  34.01 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349831  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2987  transcriptional activator, TenA family  30.56 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70077  Phosphomethylpyrimidine kinase THI21 (HMP-phosphate kinase) (HMP-P kinase)  29.31 
 
 		 583 aa  95.9  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.583202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0097  transcriptional activator, TenA family  36.14 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.658619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  30.7 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2438  transcriptional activator, TenA family  31.1 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000793245  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0480  TenA family transcription regulator  29.44 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00667061  hitchhiker  0.000776397 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0361  TenA family transcriptional activator  29.9 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2186  TenA family transcription regulator  31.02 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1351  TenA family transcription regulator  31.09 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000186678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  40.41 
 
 		 499 aa  88.6  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1974  TenA family transcription regulator  31.65 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.547814  hitchhiker  0.000000287748 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03941  TENA/THI-4 protein  28.35 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.511301  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1074  TenA family transcription regulator  31.65 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1931  transcriptional activator, TenA family  31.19 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03931  TENA/THI-4 protein  28.35 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1007  transcriptional activator, TenA family  33.33 
 
 		 208 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691349 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0606  transcriptional activator, TenA family  31.28 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00086118  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0044  TenA family transcriptional activator  33.33 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88734  predicted protein  32.16 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.6901  normal  0.220592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3392  TenA family transcription regulator  34.21 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  0.0978222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4918  transcriptional activator, TenA family  34.74 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3844  putative transcriptional activator, TenA family  29.53 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.077878  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2584  transcriptional activator TenA  27.44 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2357  transcriptional activator  27.91 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0805  TenA family transcription regulator  29.29 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4829  transcriptional activator, TenA family  32.08 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2629  transcriptional activator TenA  27.91 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2436  transcriptional activator TenA  27.91 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2391  transcriptional activator  27.91 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2611  transcriptional activator TenA  27.91 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.204985  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0123  putative transcriptional activator, TenA family  32.26 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1892  TenA family transcription regulator  26.51 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0105459  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1431  TenA family transcription regulator  30.84 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2668  transcriptional activator TenA  27.91 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.358374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2739  transcriptional activator TenA  27.44 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376117  hitchhiker  0.00000275014 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2628  transcriptional activator TenA  27.91 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000192949 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7784  transcriptional activator, TenA family  36.32 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0025  transcriptional activator, TenA family  30.14 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2462  transcriptional activator, TenA family  33.73 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2523  TenA family transcription regulator  27.44 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025683  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1094  TenA family transcriptional activator  31.41 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331158  hitchhiker  0.000493191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3256  TenA family transcription regulator  31.87 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4521  transcriptional activator, TenA family  29.69 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0629922  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0021  TenA family transcription regulator  31.79 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2439  TenA family transcription regulator  31.82 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576095  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4968  transcriptional activator, TenA family  35.79 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356568  normal  0.0204405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2138  putative transcriptional activator, TenA family  32.64 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0407  transcriptional activator, TenA family  29.58 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0089  transcriptional activator, TenA family  29.49 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1028  TenA family transcription regulator  29.49 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5262  transcriptional activator, TenA family  30.05 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4256  transcriptional activator, TenA family  28.12 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0357  TenA family transcription regulator  33.16 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>