More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3120 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3120  aldo/keto reductase family oxidoreductase  100 
 
 
253 aa  516  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00828042  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2596  aldo/keto reductase  99.21 
 
 
273 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2737  aldo/keto reductase  93.68 
 
 
273 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2429  aldo/keto reductase  86.96 
 
 
270 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43714  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4714  oxidoreductase  70.36 
 
 
273 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3732  aldo/keto reductase  71.94 
 
 
273 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53850  oxidoreductase  68.38 
 
 
273 aa  360  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3700  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  69.17 
 
 
273 aa  355  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1775  aldo/keto reductase  69.17 
 
 
273 aa  352  3e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.316569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1256  aldo/keto reductase  69.57 
 
 
273 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332065  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4255  aldo/keto reductase  62.65 
 
 
278 aa  312  3e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0706708 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2259  aldo/keto reductase  62.07 
 
 
283 aa  312  4e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1963  aldo/keto reductase  60.54 
 
 
283 aa  306  1e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.152585  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1975  aldo/keto reductase  61.69 
 
 
284 aa  305  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2217  aldo/keto reductase  61.69 
 
 
283 aa  305  5e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3314  aldo/keto reductase  62.79 
 
 
283 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1673  aldo/keto reductase  59 
 
 
284 aa  300  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  59.39 
 
 
282 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  59.39 
 
 
282 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  59.39 
 
 
282 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  59.39 
 
 
282 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9019  aldo/keto reductase family oxidoreductase  58.75 
 
 
277 aa  298  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  60.69 
 
 
296 aa  297  9e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1997  aldo/keto reductase  58.75 
 
 
281 aa  295  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  58.62 
 
 
282 aa  294  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2530  aldo/keto reductase  58.37 
 
 
282 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  57.47 
 
 
284 aa  291  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2789  aldo/keto reductase  60.31 
 
 
282 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158204  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  56.7 
 
 
284 aa  288  5e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  56.7 
 
 
284 aa  288  5e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  56.7 
 
 
284 aa  288  5e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.47998e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  56.7 
 
 
284 aa  288  5e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  56.7 
 
 
284 aa  288  5e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  59.53 
 
 
281 aa  288  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  56.7 
 
 
284 aa  287  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1410  aldo/keto reductase family oxidoreductase  56.7 
 
 
284 aa  286  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2006  aldo/keto reductase  58.37 
 
 
281 aa  285  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2369  aldo/keto reductase  54.02 
 
 
294 aa  282  3e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2029  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  55.94 
 
 
284 aa  280  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.848992  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3181  aldo/keto reductase  57.98 
 
 
281 aa  280  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000770886 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  52.14 
 
 
281 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  56.42 
 
 
277 aa  279  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0784  aldo/keto reductase family oxidoreductase  57.98 
 
 
281 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.756682  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2449  aldo/keto reductase  57.59 
 
 
281 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  2.71935e-06 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0764  aldo/keto reductase  57.98 
 
 
281 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421466 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2579  aldo/keto reductase  57.59 
 
 
281 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5863  aldo/keto reductase  56.03 
 
 
281 aa  273  2e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1775  aldo/keto reductase  55.12 
 
 
276 aa  271  6e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0360255  normal  0.42247 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0755  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.86 
 
 
281 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.181791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2555  aldo/keto reductase  55.25 
 
 
281 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1919  aldo/keto reductase  55.25 
 
 
281 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2531  aldo/keto reductase  55.25 
 
 
281 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383161  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0948  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.09 
 
 
286 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0952  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.09 
 
 
281 aa  265  6e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1101  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.09 
 
 
281 aa  265  6e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.16541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2128  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.7 
 
 
286 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0551  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.7 
 
 
286 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2256  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.7 
 
 
281 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  53.41 
 
 
277 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2881  aldo/keto reductase  56.03 
 
 
277 aa  261  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3054  aldo/keto reductase  55.73 
 
 
284 aa  258  5e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00284405  normal  0.275576 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2007  aldo/keto reductase  54.09 
 
 
277 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.664286  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1699  aldo/keto reductase  54.09 
 
 
277 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  53.7 
 
 
280 aa  253  1e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1308  aldo/keto reductase  46.56 
 
 
282 aa  238  7e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3502  aldo/keto reductase  58.58 
 
 
276 aa  238  8e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0118394  normal  0.431594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0715  aldo/keto reductase  50.78 
 
 
282 aa  238  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1860  aldo/keto reductase  45 
 
 
279 aa  236  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.97966e-09  hitchhiker  1.47499e-10 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2824  putative aldo/keto reductase  52.71 
 
 
279 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  51.71 
 
 
279 aa  234  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0138  aldo/keto reductase  50.39 
 
 
279 aa  232  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  51.55 
 
 
279 aa  231  7e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5774  aldo/keto reductase  50.41 
 
 
275 aa  230  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2442  aldo/keto reductase  53.23 
 
 
281 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2893  aldo/keto reductase  50.38 
 
 
289 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0706  aldo/keto reductase  43.18 
 
 
284 aa  226  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  9.23637e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3942  aldo/keto reductase  53.96 
 
 
285 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0842861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3345  aldo/keto reductase  50.21 
 
 
300 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3254  aldo/keto reductase  52.85 
 
 
281 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3195  aldo/keto reductase  50.95 
 
 
288 aa  216  3e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2211  aldo/keto reductase  50.19 
 
 
281 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684458  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3173  aldo/keto reductase  47.91 
 
 
279 aa  197  2e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115675  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1578  aldo/keto reductase  41.6 
 
 
281 aa  179  4e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0586561  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1557  aldo/keto reductase  42.68 
 
 
270 aa  167  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0142  aldo/keto reductase  39.68 
 
 
280 aa  166  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0944  aldo/keto reductase  41.39 
 
 
281 aa  164  1e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1806  aldo/keto reductase  42.68 
 
 
272 aa  161  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.155578 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1630  aldo/keto reductase  42.74 
 
 
270 aa  159  5e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0593  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
292 aa  153  3e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  8.35001e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  40.16 
 
 
274 aa  152  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  40.16 
 
 
274 aa  152  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0946  aldo/keto reductase  34.3 
 
 
265 aa  148  8e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.837346  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  42.55 
 
 
274 aa  147  1e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0489  aldo/keto reductase  38.43 
 
 
277 aa  146  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  36.32 
 
 
275 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  33.96 
 
 
319 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  33.96 
 
 
319 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  35.9 
 
 
274 aa  141  1e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  35.62 
 
 
275 aa  140  1e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  34.66 
 
 
281 aa  141  1e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>