More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3000 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3000  MaoC domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  315  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0628235  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2693  dehydratase  99.34 
 
 		 151 aa  313  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6022  dehydratase  88.51 
 
 		 152 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6245  dehydratase  88.51 
 
 		 152 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6530  dehydratase  88.51 
 
 		 152 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82464  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5530  MaoC-like dehydratase  85.43 
 
 		 152 aa  275  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6403  dehydratase  85.43 
 
 		 152 aa  275  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394709 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5894  dehydratase  85.43 
 
 		 152 aa  275  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36432  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6129  dehydratase  86.3 
 
 		 153 aa  274  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5510  MaoC domain protein dehydratase  84.46 
 
 		 152 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.427484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4505  MaoC-like dehydratase  83.78 
 
 		 161 aa  268  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.547822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1553  dehydratase  79.59 
 
 		 161 aa  258  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  41.89 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  41.96 
 
 		 160 aa  113  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  38.19 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  38.46 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  35.37 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4972  dehydratase  30.92 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810088  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 		 464 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18160  hypothetical protein  33.97 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  30.82 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  30.46 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  32.67 
 
 		 686 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  33.78 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3838  MaoC-like dehydratase  30.99 
 
 		 156 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2976  dehydratase  34.46 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  30.67 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3568  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.66 
 
 		 500 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4100  MaoC-like domain protein  30.99 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1662  dehydratase  37.24 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1039  dehydratase  33.11 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  32.56 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 		 686 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3315  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.94 
 
 		 470 aa  67  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.745735 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  31.47 
 
 		 146 aa  67  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0849  MaoC-like dehydratase  32.47 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4109  dehydratase  32.19 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294085  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  29.25 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3543  MaoC-like dehydratase  31.17 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.925592  normal  0.245974 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1356  (de)hydratase  31.47 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  31.85 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0620  MaoC-like dehydratase  31.17 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  31.85 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  31.01 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  30.28 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  30.67 
 
 		 679 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2329  MaoC domain protein dehydratase  32.62 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2194  MaoC-like dehydratase  34.97 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  32.09 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  31.01 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  30.34 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2396  dehydratase  35.56 
 
 		 334 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0902471  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3209  MaoC domain protein dehydratase  34.69 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0647415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  31.01 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_003296  RS05499  hypothetical protein  31.97 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  30.41 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.57 
 
 		 695 aa  63.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.39 
 
 		 690 aa  63.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4127  dehydratase  30.07 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2549  dehydratase  27.89 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0407782  normal  0.257026 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  31.82 
 
 		 681 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3797  dehydratase  30.71 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1425  maoC family protein  29.93 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8223  MaoC domain protein dehydratase  29.8 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.924905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 		 681 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3980  maoC family protein  29.93 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1226  maoC family protein  29.93 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1203  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.93 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1205  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.93 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1326  MaoC family protein  29.93 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1466  maoC family protein  29.93 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1364  maoC family protein  29.93 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.168458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1401  maoC family protein  29.93 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  30.08 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  30.14 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30160  3-Re enoyl-CoA hydratase PhaJ  31.58 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1030  MaoC domain protein dehydratase  29.66 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  27.4 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  29.33 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 		 681 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 		 683 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3294  FkbR2  33.33 
 
 		 175 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.754163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  26.35 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3463  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3368  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.487735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.864271 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4680  dehydratase  30.99 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 684 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1539  maoC-related protein  32.48 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.250749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 		 684 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  31.58 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.16 
 
 		 684 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 		 681 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  30.14 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2320  MaoC domain protein dehydratase  37.23 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1191  MaoC-like dehydratase  32.12 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  26.32 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4316  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30 
 
 		 481 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4426  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30 
 
 		 481 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  30.95 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>