198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2992 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2992  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152511  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  95.58 
 
 		 249 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  46.56 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.56 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0433  ThiJ/PfpI domain protein  47.49 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  47.32 
 
 		 235 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  46.9 
 
 		 228 aa  221  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2964  ThiJ/PfpI domain protein  46.43 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4305  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.67 
 
 		 231 aa  218  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3475  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.9 
 
 		 232 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7474  ThiJ/PfpI family protein  48.23 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  45.58 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50 
 
 		 227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.383076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3997  hypothetical protein  46.9 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2442  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.49 
 
 		 227 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197595  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4591  thiJ/pfpI family protein  43.3 
 
 		 229 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.526162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4576  thiJ/pfpI family protein  43.44 
 
 		 227 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4381  thiJ/pfpI family protein  43.44 
 
 		 227 aa  205  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  42.86 
 
 		 229 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4720  thiJ/pfpI family protein  43.44 
 
 		 227 aa  205  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.122837  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.16 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4606  thiJ/pfpI family protein  42.22 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4222  thiJ/PfpI family protein  42.53 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3431  ThiJ/PfpI domain protein  42.74 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3087  ThiJ/PfpI domain protein  46.46 
 
 		 230 aa  198  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00619766  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  42.86 
 
 		 232 aa  198  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2504  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.88 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  44.16 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0152  ThiJ/PfpI domain protein  41.38 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  41.07 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  43.04 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  41.48 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.32 
 
 		 232 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl402  putative PFPI-like cystiene protease  40.87 
 
 		 226 aa  178  8e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  38.55 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1995  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.24 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  37.66 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.01 
 
 		 237 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.57 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  40 
 
 		 226 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  37.78 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  36.92 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.56 
 
 		 227 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  36.64 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.22 
 
 		 231 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  35.84 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0629  thiJ/pfpI family protein  44.59 
 
 		 166 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.2762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3106  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.89 
 
 		 223 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.424885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.1 
 
 		 242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  37.39 
 
 		 221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  38.5 
 
 		 227 aa  152  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  34.96 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  35.11 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  34.96 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.36 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  37.38 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  36.96 
 
 		 224 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.73 
 
 		 227 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  34.2 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  36.52 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1285  DJ-1/PfpI family protein  36.64 
 
 		 357 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  36.44 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  35.56 
 
 		 223 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.61 
 
 		 224 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  38.33 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  39.11 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1296  putative intracellular protease/amidase  44.65 
 
 		 175 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.07 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  33.93 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2524  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.15 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.36 
 
 		 228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.4 
 
 		 227 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.19 
 
 		 229 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  38.61 
 
 		 220 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  36.96 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.12 
 
 		 228 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  38.05 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.65 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  34.91 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  30.92 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  38.12 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.23 
 
 		 224 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.84 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.96 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.68 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  35.53 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.8 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.96 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.96 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  35.4 
 
 		 227 aa  140  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  37.62 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  34.96 
 
 		 230 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  36.44 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  37.2 
 
 		 220 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  32.74 
 
 		 227 aa  138  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  34.82 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  34.51 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  34.51 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  34.07 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  34.51 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>