125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2979 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  283  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  51.26 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  51.18 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  52.14 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  47.62 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  48.31 
 
 		 132 aa  120  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  49.56 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  49.58 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  50.98 
 
 		 386 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  52.99 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  51.06 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  44.74 
 
 		 133 aa  107  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  49.5 
 
 		 129 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  44.07 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  49.14 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  45.67 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  49.53 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  49.57 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  45.61 
 
 		 118 aa  99.4  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  48.31 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  43.59 
 
 		 386 aa  96.7  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  43.14 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  49.18 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  54.64 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  43.7 
 
 		 126 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  43.7 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  38.98 
 
 		 127 aa  90.1  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  41.74 
 
 		 121 aa  88.6  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  44.83 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  55.07 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  43.37 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  41.03 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  40 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  47.58 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  48.1 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  44.87 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  47.58 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  50.62 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  39.74 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  40 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  41.25 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  43.04 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  41.67 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  36.25 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  46.38 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  38.83 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  37.14 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  30.85 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  34.04 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  34.04 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  25.64 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  32.98 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  32.98 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  32.98 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  32.98 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  32.98 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  32.98 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  32.98 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  26.8 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  26 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  46.67 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  26.8 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  31.91 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  26.32 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  38.75 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  40.82 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  36.36 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  31.58 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  29.89 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  32.35 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  32.35 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  40.68 
 
 		 249 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  32.35 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  32.53 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  32.35 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0363  hypothetical protein  36.36 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  26.44 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  31.25 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  26.8 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  29.11 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  36.07 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  27.96 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  32.1 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  27.71 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  27.63 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  31.43 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  29.76 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  34.04 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  31.43 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  30.53 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  25.74 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  29.07 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  31.43 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0426  hypothetical protein  47.83 
 
 		 50 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  32.22 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  45.24 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  32.26 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>