205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2974 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  65.35 
 
 		 685 aa  702    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  65.16 
 
 		 685 aa  702    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  100 
 
 		 550 aa  1126    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  61.9 
 
 		 695 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  61.87 
 
 		 695 aa  675    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  61.99 
 
 		 697 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  66.19 
 
 		 717 aa  679    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  63.64 
 
 		 700 aa  701    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  64.54 
 
 		 685 aa  701    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  65.23 
 
 		 690 aa  710    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  63.38 
 
 		 700 aa  686    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  29.51 
 
 		 670 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  29.96 
 
 		 670 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  27.63 
 
 		 635 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  29.65 
 
 		 682 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  29.16 
 
 		 633 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  27.7 
 
 		 645 aa  182  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  30.73 
 
 		 678 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  28.57 
 
 		 633 aa  180  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  27.94 
 
 		 649 aa  179  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  26.82 
 
 		 633 aa  178  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  28.66 
 
 		 633 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  27.96 
 
 		 663 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  29.69 
 
 		 656 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  29.16 
 
 		 654 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  30.62 
 
 		 662 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  28.77 
 
 		 660 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  27.71 
 
 		 646 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  28.77 
 
 		 654 aa  170  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  28.46 
 
 		 654 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  28.65 
 
 		 654 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  27.74 
 
 		 671 aa  169  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  28.65 
 
 		 654 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  28.27 
 
 		 654 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  28.4 
 
 		 654 aa  166  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  27.04 
 
 		 652 aa  166  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  28.85 
 
 		 654 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  28.84 
 
 		 634 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  27.62 
 
 		 646 aa  163  7e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  28.12 
 
 		 665 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  29.96 
 
 		 657 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  28.24 
 
 		 646 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  28.94 
 
 		 677 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  29.67 
 
 		 628 aa  160  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  29.26 
 
 		 654 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  28.35 
 
 		 653 aa  159  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  25.93 
 
 		 640 aa  157  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  29.12 
 
 		 649 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  24.95 
 
 		 621 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  28.94 
 
 		 677 aa  153  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  27.78 
 
 		 666 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  27.69 
 
 		 647 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  31.58 
 
 		 656 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  27.18 
 
 		 695 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  24.72 
 
 		 712 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  24.95 
 
 		 611 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  25.86 
 
 		 650 aa  140  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  25.27 
 
 		 696 aa  137  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  27.97 
 
 		 652 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  34.6 
 
 		 633 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  25.9 
 
 		 651 aa  130  7.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  28.44 
 
 		 712 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  30.77 
 
 		 643 aa  116  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  28.57 
 
 		 597 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  25.05 
 
 		 628 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  26.19 
 
 		 645 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  26.61 
 
 		 643 aa  105  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0242  sulfatase  25.2 
 
 		 666 aa  99.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  21.35 
 
 		 666 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  21.66 
 
 		 639 aa  97.4  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  23.36 
 
 		 642 aa  94.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2550  sulfatase  25.95 
 
 		 692 aa  92.8  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.564783  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  24.09 
 
 		 641 aa  91.3  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  30.77 
 
 		 640 aa  90.5  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0322  sulfatase  23.51 
 
 		 662 aa  87  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  24.22 
 
 		 639 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  24.22 
 
 		 639 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  24.22 
 
 		 639 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  24.22 
 
 		 639 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  24.22 
 
 		 639 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  24.22 
 
 		 639 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  24.22 
 
 		 639 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  24.22 
 
 		 639 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  24.69 
 
 		 639 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  23.58 
 
 		 630 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  23.44 
 
 		 639 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1015  sulfatase  27.23 
 
 		 588 aa  80.9  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  23.11 
 
 		 642 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  25.71 
 
 		 630 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  22.69 
 
 		 642 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  23.11 
 
 		 642 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  25.19 
 
 		 628 aa  79.7  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  23.11 
 
 		 642 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  23.11 
 
 		 642 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0187  membrane protein  21.44 
 
 		 659 aa  79.7  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0462581  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0157  membrane associated sulfatase  21.44 
 
 		 659 aa  79.7  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  23.11 
 
 		 642 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  23.11 
 
 		 642 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  22.27 
 
 		 642 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  22.27 
 
 		 642 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>