46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2891 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2891  acetyltransferase  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00698581  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
216 aa  445  1e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2891  GCN5-related N-acetyltransferase  97.22 
 
 
216 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0118501  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  89.57 
 
 
216 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130564  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  75 
 
 
216 aa  336  2e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  68.75 
 
 
214 aa  304  8e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2477  hypothetical protein  62.25 
 
 
223 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184959  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2748  hypothetical protein  59.63 
 
 
223 aa  277  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28870  GCN5-related N-acetyltransferase  60.29 
 
 
223 aa  272  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  59.72 
 
 
237 aa  267  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.286419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2693  hypothetical protein  62.69 
 
 
210 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  42.79 
 
 
223 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03041  predicted acetyltransferase, GNAT family  34.05 
 
 
215 aa  132  4e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1255  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 
209 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
215 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  31.77 
 
 
212 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1467  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
215 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1431  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
215 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1437  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
215 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
212 aa  121  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2655  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
212 aa  121  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
212 aa  119  5e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2722  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
212 aa  117  1e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1126  acetyltransferase  30.19 
 
 
213 aa  117  2e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1614  acetyltransferase  30.43 
 
 
212 aa  116  2e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2648  GCN5-related N-acetyltransferase  33.68 
 
 
216 aa  112  4e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3294  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 
215 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  2.78112e-06 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3529  hypothetical protein  31.52 
 
 
223 aa  111  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  30.73 
 
 
212 aa  110  2e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.289244  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3173  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
215 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3188  hypothetical protein  31.15 
 
 
214 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7239  GCN5-related N-acetyltransferase  22.81 
 
 
203 aa  52.4  5e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343936  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0677  acetyltransferase  20.53 
 
 
202 aa  49.7  3e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1896  acetyltransferase  26.61 
 
 
295 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.108924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  23.88 
 
 
197 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1886  acetyltransferase  27.68 
 
 
295 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.708702  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
186 aa  45.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2180  acetyltransferase, GNAT family  25.81 
 
 
295 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2112  acetyltransferase, GNAT family  26.61 
 
 
295 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0591  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.28295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2071  acetyltransferase, GNAT family  27.97 
 
 
289 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 
312 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1934  acetyltransferase  24.19 
 
 
295 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2081  acetyltransferase  24.19 
 
 
295 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3234  acetyltransferase, GNAT family  26.55 
 
 
295 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.157565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
198 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>