77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2743 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2743  acetyltransferase  100 
 
 
197 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14778  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3010  GCN5-related N-acetyltransferase  98.48 
 
 
197 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  92.89 
 
 
197 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.634781 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0625  GCN5-related N-acetyltransferase  42.39 
 
 
195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1775  GCN5-related N-acetyltransferase  37.95 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3674  acetyltransferase  32.62 
 
 
209 aa  85.9  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
193 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343448  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2560  acetyltransferase  27.57 
 
 
186 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.87782  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  22.78 
 
 
192 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131374  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1761  GCN5-related N-acetyltransferase  25.91 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2487  acetyltransferase  33.85 
 
 
168 aa  54.3  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3310  GCN5-related N-acetyltransferase  27.42 
 
 
186 aa  53.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0422  acetyltransferase  21.86 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4290  GCN5-related N-acetyltransferase  27.43 
 
 
190 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2062  GCN5-related N-acetyltransferase  22.22 
 
 
195 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1465  acetyltransferase  23.46 
 
 
192 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1505  acetyltransferase, GNAT family  22.91 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1515  acetyltransferase  27.11 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.42472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3942  acetyltransferase, GNAT family  24.02 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000096173  decreased coverage  0.00543726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 
161 aa  48.5  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195178  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1263  acetyltransferase  22.91 
 
 
192 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0337947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1236  acetyltransferase  22.91 
 
 
192 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1437  acetyltransferase, GNAT family  22.91 
 
 
192 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.69581e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1366  acetyltransferase  22.91 
 
 
192 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000207819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1238  acetyltransferase  21.79 
 
 
192 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00169665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1401  acetyltransferase, GNAT family  24.02 
 
 
192 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000159569  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  30.84 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  38.18 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18031  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
163 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.142661 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.43 
 
 
151 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0193  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1263  GCN5-related N-acetyltransferase  23.46 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00359187  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12180  acetyltransferase (GNAT) family protein  43.28 
 
 
170 aa  45.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6014  GCN5-related N-acetyltransferase  27.98 
 
 
192 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0760  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
156 aa  45.1  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416915  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1923  GCN5-related N-acetyltransferase  21.48 
 
 
186 aa  44.7  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2150  acetyltransferase  26.67 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000318542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1296  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1265  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3831  acetyltransferase  32.63 
 
 
137 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0070  hypothetical protein  31.82 
 
 
494 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3326  GCN5-related N-acetyltransferase  41.07 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33834  predicted protein  22.47 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0714  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2948  streptothricin acetyltransferase  27.38 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131684  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0895  hypothetical protein  36.96 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  43.86 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0909  acetyltransferase  37.29 
 
 
154 aa  42.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.48 
 
 
163 aa  43.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2961  streptothricin acetyltransferase  26.19 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4879  GCN5-related N-acetyltransferase  41.54 
 
 
163 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3192  putative streptothricin acetyltransferase  26.19 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3185  streptothricin acetyltransferase  26.19 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.95857  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2339  GCN5-like N-acetyltransferase  36.21 
 
 
200 aa  42.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00797251  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2340  GCN5-related N-acetyltransferase  33.68 
 
 
168 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0612  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 
183 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2478  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
167 aa  42.4  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.263988  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1887  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
215 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0245  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 
220 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
153 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3197  streptothricin acetyltransferase, putative  26.19 
 
 
184 aa  42  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.288156  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.78 
 
 
146 aa  42  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22690  predicted acyltransferase  34.15 
 
 
166 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.222073 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000877  ribosomal-protein-S18p-alanine acetyltransferase  39.29 
 
 
170 aa  42  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.929276  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06852  hypothetical protein  28.22 
 
 
166 aa  41.6  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1294  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
154 aa  41.6  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.7344300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1485  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
161 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3166  acetyltransferase, GNAT family  31.67 
 
 
153 aa  41.2  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0840877  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
198 aa  41.2  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2762  GCN5-related N-acetyltransferase  31.67 
 
 
153 aa  41.2  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0771  pantoate--beta-alanine ligase  30.3 
 
 
137 aa  41.2  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3691  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
147 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346698  normal  0.265103 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3834  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
147 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0378234  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02870  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11780)  24.72 
 
 
366 aa  41.2  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
174 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.206769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3167  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
137 aa  41.2  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4529  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
147 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.822074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>