214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2693 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  100 
 
 
328 aa  681  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  99.09 
 
 
328 aa  676  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  68.69 
 
 
332 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  64.04 
 
 
329 aa  443  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  60.68 
 
 
329 aa  435  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  61.51 
 
 
329 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  63.09 
 
 
346 aa  433  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  59.94 
 
 
329 aa  429  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  61.2 
 
 
329 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  59.94 
 
 
327 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  58.95 
 
 
326 aa  416  1e-115  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  63.02 
 
 
336 aa  408  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  55.84 
 
 
323 aa  363  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  43.49 
 
 
323 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  38.87 
 
 
325 aa  246  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  38.24 
 
 
332 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  37.42 
 
 
325 aa  236  5e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  38.56 
 
 
325 aa  235  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  38.12 
 
 
325 aa  233  2e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  36.96 
 
 
320 aa  234  2e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  38.12 
 
 
325 aa  233  4e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  38.12 
 
 
325 aa  233  4e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  38.12 
 
 
325 aa  233  4e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  38.12 
 
 
325 aa  233  4e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  35.37 
 
 
323 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  35.37 
 
 
323 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  35.78 
 
 
323 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  35.78 
 
 
323 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  36.09 
 
 
323 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  35.33 
 
 
328 aa  226  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  35.47 
 
 
323 aa  226  5e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  35.47 
 
 
323 aa  226  5e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  35.47 
 
 
323 aa  226  5e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  35.47 
 
 
323 aa  226  5e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  35.47 
 
 
323 aa  226  5e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  36.16 
 
 
324 aa  226  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  33.96 
 
 
323 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  34.45 
 
 
323 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  36.99 
 
 
325 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  36.02 
 
 
325 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  36.99 
 
 
325 aa  223  5e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  35.28 
 
 
323 aa  221  1e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  34.56 
 
 
323 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  34.56 
 
 
323 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  34.56 
 
 
323 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  34.25 
 
 
323 aa  216  3e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  34.56 
 
 
323 aa  217  3e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  34.56 
 
 
323 aa  217  3e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  34.56 
 
 
323 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  33.94 
 
 
323 aa  214  1e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  34.18 
 
 
323 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  33.99 
 
 
332 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  31.53 
 
 
368 aa  165  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  32.95 
 
 
357 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  29.45 
 
 
386 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  30.86 
 
 
377 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  32.67 
 
 
327 aa  153  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  31.52 
 
 
399 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  32.58 
 
 
332 aa  132  6e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  28.35 
 
 
311 aa  131  2e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  30.23 
 
 
400 aa  130  4e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  23.51 
 
 
348 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  29.02 
 
 
335 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  30.22 
 
 
333 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  23.91 
 
 
402 aa  117  2e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  29.27 
 
 
311 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  26.42 
 
 
379 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  30.53 
 
 
333 aa  116  4e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  29.53 
 
 
317 aa  114  2e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  27.7 
 
 
329 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  27.24 
 
 
307 aa  112  1e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  27.81 
 
 
433 aa  111  2e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  4.16179e-06  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  28.21 
 
 
315 aa  110  4e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.19053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  28.36 
 
 
602 aa  110  4e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  26.13 
 
 
399 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  28.87 
 
 
312 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  27.04 
 
 
337 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  27.27 
 
 
363 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  30.24 
 
 
312 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  25.86 
 
 
438 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  26.89 
 
 
396 aa  106  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  22.06 
 
 
326 aa  105  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  31.61 
 
 
306 aa  106  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  25.56 
 
 
385 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  27.21 
 
 
345 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  22.1 
 
 
399 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  25.75 
 
 
311 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  25.14 
 
 
444 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  29.35 
 
 
315 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  24.74 
 
 
297 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  26.24 
 
 
387 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3756  peptidase M19, renal dipeptidase  27.03 
 
 
388 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  26.24 
 
 
387 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  29.73 
 
 
439 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  24.22 
 
 
433 aa  99  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  25.86 
 
 
387 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  25.71 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  25.35 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  27.48 
 
 
328 aa  97.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.44928e-05  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  31.55 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>